Выравнивание последовательности печати в файл

Я делаю простое попарное выравнивание последовательностей ДНК с помощьюpairwiseAlignment из пакета Biostrings в Bioconductor:

library('Biostrings')
seq1 = 'ATGCTA'
seq2 = 'ATGTA'
pairwiseAlignment(pattern = seq1, subject = seq2)

Вывод выглядит следующим образом:

Global PairwiseAlignedFixedSubject (1 of 1)
pattern: [1] ATGCTA 
subject: [1] ATG-TA 
score: -4.091219 

Для очень длинных последовательностей вывод усекается и отображается только одна строка:

Global PairwiseAlignedFixedSubject (1 of 1)
pattern: [1] AT-------------------------------------------------...----------------TGTCTTCCAKATCTGGCGCGCCTGGGTTGATATC 
subject: [1] ATTGGCGGCCGCGCCACCATGCCAGAGCCAGCGAAGTCTGCTCCCGCCCCG...GAAGGCTGTATGCTGTTGTCTTCAAGATCTGGTACCGCTGGGTTGATATC 
score: -29418.8

Как я могу вывести полное выравнивание в текстовый файл?