У меня проблема, когда мои преобразования css3 влияют на другие элементы на странице и даже вызывают их мерцание. Я видел другой пост об этом, но у них не было решения проблемы.
http://scosha.mybigcommerce.com/w107b/ при прокрутке навигации вы видите анимированный преобразование css3. Он отлично работает в Firefox без мерцания, но с Chrome и Safari эффект очень очевиден, вы видите его в пунктах раскрывающегося меню, а также в тексте нижнего колонтитула.