Настройки уровня приложения в DDD?

Я бы сказал, что то, является ли значение настраиваемым или нет, не имеет значения с точки зрения модели предметной области - важно то, что оно определено извне.

Допустим, у вас есть класс, который должен иметь имя. Если имя требуется всегда, оно должно быть инкапсулировано как инвариант независимо от источника значения. Вот пример С#:

public class MyClass
{
    private string name;

    public MyClass(string name)
    {
        if(name == null)
        {
            throw new ArgumentNullException("name");
        }

        this.name = name;
    }

    public string Name
    {
        get { return this.name; }
        set
        {
            if(value == null)
            {
                throw new ArgumentNullException("name");
            }
            this.name = value;
        }
    }
}

Подобный класс эффективно защищает инвариант: имя не должно быть нулевым. Модели предметной области должны инкапсулировать подобные инварианты независимо от того, какой потребитель будет их использовать, иначе они не будут соответствовать цели гибкого проектирования.

Но вы спросили о значениях по умолчанию. Если у вас есть хорошее значение по умолчанию для имени, то как вы передаете это значение по умолчанию MyClass.

Вот где Фабрики пригодятся. Вы просто отделяете построение своих объектов от их реализации. Часто это хорошая идея в любом случае. Независимо от того, выберете ли вы абстрактную фабрику или реализацию Builder, менее важно, но абстрактная фабрика — хороший выбор по умолчанию.

В случае с MyClass мы могли бы определить интерфейс IMyClassFactory:

public interface IMyClassFactory
{
    MyClass Create();
}

Теперь вы можете определить реализацию, которая извлекает имя из файла конфигурации:

public ConfigurationBasedMyClassFactory : IMyClassFactory
{
    public MyClass Create()
    {
        var name = ConfigurationManager.AppSettings["MyName"];
        return new MyClass(name);
    }
}

Убедитесь, что код, которому нужны экземпляры MyClass, использует IMyClassFactory для его создания, а не вручную.