Найти все различия между файлами .mat

Простой общий ответ, без отображения различий в значениях

Благодаря пониманию, которое я получил из ответов @BHF, @Daniel R и @Dennis Jaheruddin, мне удалось найти простое масштабируемое решение:

[fs1, fs2, er] = comp_struct(load('f1.mat'),load('f2.mat'))

Обратите внимание, что это работает для .mat, содержащего произвольное количество переменных.

Для этого используется Сравнить структуры — отправка файлов для обмена.

Найти все различия между файлами матов без MATLAB?

Вы можете найти различия между HDF5 на основе файлы .mat с Инструменты HDF5.

Пример

Позвольте мне сократить ваш пример MATLAB и предположить, что вы создаете два матовых файла с

clear ; a = 6 ; b.c = 'hello' ; save -v7.3 f1
clear ; a = 7 ; b.e = 'world' ; save -v7.3 f2

Использование вне MATLAB

h5ls -v -r f1.mat

чтобы получить список данных, включенных в f1.mat:

Opened "f1.mat" with sec2 driver.
/                        Group
    Location:  1:96
    Links:     1
/a                       Dataset {1/1, 1/1}
    Attribute: MATLAB_class scalar
        Type:      6-byte null-terminated ASCII string
        Data:  "double"
    Location:  1:2576
    Links:     1
    Storage:   8 logical bytes, 8 allocated bytes, 100.00% utilization
    Type:      native double
/b                       Group
    Attribute: MATLAB_class scalar
        Type:      6-byte null-terminated ASCII string
        Data:  "struct"
    Location:  1:800
    Links:     1
/b/c                     Dataset {5/5, 1/1}
    Attribute: H5PATH scalar
        Type:      2-byte null-terminated ASCII string
        Data:  "/b"
    Attribute: MATLAB_class scalar
        Type:      4-byte null-terminated ASCII string
        Data:  "char"
    Attribute: MATLAB_int_decode scalar
        Type:      native int
        Data:  2
    Location:  1:1832
    Links:     1
    Storage:   10 logical bytes, 10 allocated bytes, 100.00% utilization
    Type:      native unsigned short

Использование

h5ls -d -r f1.mat

возвращает значения сохраненных данных:

/                        Group
/a                       Dataset {1, 1}
    Data:
        (0,0) 6
/b                       Group
/b/c                     Dataset {5, 1}
    Data:
        (0,0) 104, 101, 108, 108, 111

Данные 104, 101, 108, 108, 111 представляют слово hello, которое можно увидеть с помощью

h5ls -d -r f1.mat | tail -1 | awk '{FS=",";printf("%c%c%c%c%c \n",$2,$3,$4,$5,$6)}'

Вы можете получить тот же список для f2.mat и сравнить два вывода с помощью инструмента по вашему выбору.

Сравнение также работает напрямую с инструментами HDF5. Чтобы сравнить два числа a из обоих файлов, используйте

h5diff -r f1.mat f2.mat /a

который покажет вам значения и их разницу

dataset: </a> and </a>
size:           [1x1]           [1x1]
position        a               a               difference          
------------------------------------------------------------
[ 0 0 ]          6               7               1              
1 differences found
attribute: <MATLAB_class of </a>> and <MATLAB_class of </a>>
0 differences found

Примечания

В инструментах HDF5 есть еще несколько команд и параметров, которые может помочь решить вашу настоящую проблему.

Двоичные дистрибутивы для Linux и Windows доступны в группе HDF. Для OS X их можно установить через MacPorts. При необходимости есть также графический интерфейс: HDFView.

Если у вас есть Simulink, вы можете использовать Simulink.saveVars для создания m -файл, который при выполнении создает такие же переменные в рабочей области:

a = 6;
b.c.d = 7;
b.c.e = 'x';
Simulink.saveVars('f1');
f = a;
clear a
b.c.e = 'y';
Simulink.saveVars('f2');
visdiff('f1.m','f2.m')

как показано на этом скриншоте

Обратите внимание, что по умолчанию он ограничивает количество элементов в массивах до 1000, и вы можете увеличить его до 10000. Массивы больше этого ограничения будут сохранены в отдельном мат-файле.

ОБНОВЛЕНИЕ: Начиная с R2014a в MATLAB добавлена ​​новая функция, похожая на Simulink.saveVars. см. matlab.io.saveVariablesToScript

Это только часть ответа, но, возможно, это поможет.

Вы можете использовать генкод, функция Matlab, которая генерирует код Matlab из переменной, так что запуск кода воспроизводит переменную. Вы делаете это для всех переменных в каждом мат-файле (требует некоторого программирования, но должно быть выполнимо) и помещаете результаты в разные .m-файлы.

Затем вы используете стандартный инструмент сравнения текстов (может быть, даже visdiff) для сравнения .m-файлов.

Есть несколько хороших инструментов для сравнения XML-файлов, я бы поступил так:

1. Загрузите struct2xml.m
2. Загрузите оба матфайла
3. Экспорт каждого с помощью struct2xml
4. сравнить, используя XMLSpy или аналогичный

Ответ для небольших файлов с отображением всех различий в значениях

По предложению @A. Donda Я пытался использовать gencode для создания переменной для всего.

Хотя это работает для моего игрушечного примера, это довольно медленно и говорит мне, что я превышаю допустимое количество переменных для моих реальных файлов .mat.

Так или иначе, для тех, кто ищет что-то работающее с небольшими файлами, выложу этот вариант:

wList=who;
for iLoop = 1:numel(wList)
    eval(['generated_' wList{iLoop} '= gencode(' wList{iLoop} ');'])
    for jLoop = 1:numel(eval(['generated_' wList{iLoop}]))
        eval(['generated_' wList{iLoop} '_' num2str(jLoop) '= generated_' wList{iLoop} '(' num2str(jLoop) ');' ])
    end
end

Хотя это может сработать, я не чувствую, что это лучший способ.

Общий ответ, без отображения различий в значениях

Благодаря пониманию, которое я получил из ответов @BHF и @Daniel R, мне удалось найти достаточно масштабируемое решение.

Шаг 1. Сохраните все переменные из каждого файла в виде единой структуры

При этом используется Сохранить рабочую область в структуру — Отправка файлового обмена .

Вот шаги, которые необходимо предпринять, если вы хотите сравнить f1.mat и f2.mat:

clear
load f1
myStruct1 = ws2struct;
save myStruct1 myStruct1 
clear
load f2
myStruct2 = ws2struct;
save myStruct2 myStruct2 
clear                    
load myStruct1
load myStruct2

Шаг 2. Сравните структуры

Для этого используется Сравнить структуры – отправка файлов в обмен.

Учитывая, что вы хотите сравнить myStruct1 и myStruct2, вы можете просто позвонить:

[fs1, fs2, er] = comp_struct(myStruct1,myStruct2)

Я был приятно удивлен тем, насколько удобочитаемым является список различий в er, вот вывод для примера, который использовался в вопросе:

er =

's2 is missing field a'
's1(1).b(1).c(1).e and s2(1).b(1).c(1).e do not match'

Обратите внимание, что он не будет отображать значения, с технической точки зрения, вероятно, не так уж сложно изменить файл m, если желательны отображения разницы значений. Однако, особенно если есть большие матрицы, я полагаю, это может привести к проблематичному выводу.