PyMOL: получить последовательность выбора

Я сделал подборку таких остатков:

fetch 1bsx
select interface_1bsx, byres((1bs and chain A) within 5A of (1bsx and chain X))

Как получить последовательность interface_1bsx?


alignment pymol
person Mehdi Nellen    schedule 03.03.2014    source источник
comment
Можно ли pyp pymol через терминал?   -  person Maarten    schedule 07.10.2014

Ответы (1)


arrow_upward
4
arrow_downward

Используйте команду iterate (pymol wiki):

iterate interface_1bsx, resn

Или, если вы предпочитаете иметь его в списке Python:

residues = []
iterate interface_1bsx, residues.append(resn)
print(residues)
person gncs    schedule 16.05.2014