Как использовать graphviz для отображения такого графика

Вы можете использовать атрибут 'pos' для размещения узлов в воображаемой сетке:

graph X
{
  a [pos="1,1"]
  b [pos="2,2"]
  c [pos="2,3"]
  d [pos="2,4"]
}

а затем используйте соответствующий флаг в программе компоновки, чтобы переопределить желание Neato разместить ваши узлы (вам также может потребоваться возиться с размером ваших узлов). Вы, вероятно, в конечном итоге с краями, которые не являются прямыми. В этом случае определите невидимые узлы для точек соединения на вашей воображаемой сетке и нарисуйте ребра от вашего верхнего узла к невидимым и от невидимых к RIL_Init и так далее. Если ваши графики большие, это будет довольно утомительно... все еще просто... и вы все равно получите все параметры вывода graphviz. Необходимость pos="1,1!" обычно тоже встречается челка, означающая «поставить именно туда».