Автоматическое исчезновение между сценами в единстве не работает на OSX

Проблема в том, что Unity в Windows использует DirectX, а не OpenGL, поэтому он там работает (как уже упоминалось в комментариях к вашему вопросу).

Просто запустите Unity с -force-opengl в Windows, и вы заметите, что там он тоже перестанет работать.

См. http://answers.unity3d.com/questions/447206/forcing-opengl-in-windows-editor.html

Дальнейшее расследование показало, что ваш шейдер не соответствует вашим потребностям. Для этого вам понадобится вершинный шейдер.

См. http://answers.unity3d.com/questions/55392/why-my-glcolor-doesnt-work.html

e.g.:

Shader "Unlit Transparent Vertex Colored" 
{
    Properties 
    {
        _MainTex ("Base (RGB) Trans (A)", 2D) = "white" {}
    }

    Category 
    {
        Tags {"Queue"="Transparent" "IgnoreProjector"="True" "RenderType"="Transparent"}
        ZWrite Off
        //Alphatest Greater 0
        Blend SrcAlpha OneMinusSrcAlpha 
        Fog { Color(0,0,0,0) }
        Lighting Off
        Cull Off //we can turn backface culling off because we know nothing will be facing backwards

        BindChannels 
        {
            Bind "Vertex", vertex
            Bind "texcoord", texcoord 
            Bind "Color", color 
        }

        SubShader   
        {
            Pass 
            {
                SetTexture [_MainTex] 
                {
                    Combine texture * primary
                }
            }
        } 
    }
}

Источник https://github.com/edbartley/BombaFiesta-Unity3D-Futile/blob/master/Assets/Resources/Shaders/UnlitTransparentVertexColored.shader

Просто сохраните этот шейдер где-нибудь в Assets/Resources, например. как test.shader и загрузите его в Awake() следующим образом:

private void Awake()
{
    DontDestroyOnLoad(this);
    m_Instance = this;
    var shader = Shader.Find("Unlit Transparent Vertex Colored"); // <= it's some kind of best practise to put shaders in separate files, and load them like this
    m_Material = new Material(shader);
}

Shader.Find http://docs.unity3d.com/ScriptReference/Shader.Find.html

Кроме того, вы должны поставить GL.Begin() в начало материала GL в методе DrawQuad().

private void DrawQuad(Color aColor,float aAlpha)
{
    aColor.a = aAlpha;
    m_Material.SetPass(0);

    GL.Begin(GL.QUADS); // <= put it here
    GL.Color(aColor);
    GL.PushMatrix();
    GL.LoadOrtho();
    GL.Vertex3(0, 0, -1);
    GL.Vertex3(0, 1, -1);
    GL.Vertex3(1, 1, -1);
    GL.Vertex3(1, 0, -1);
    GL.End();
    GL.PopMatrix();
}

Работает как шарм для меня, теперь. :-)

Дайте мне знать, если у вас есть какие-либо проблемы с этим!

Старый ответ:

Я сохранил свой первый ответ, так как это хороший альтернативный подход к этой проблеме.

Похоже, это проблема с OpenGL, так как он также не работает в Windows с Unity 4.6.3 с использованием -force-opengl, как уже упоминалось в комментариях к вашему вопросу (отлично работает без форсирования OpenGL).

См. http://answers.unity3d.com/questions/447206/forcing-opengl-in-windows-editor.html

Итак, я бы предложил использовать следующий подход, поскольку он работает как с OpenGL, так и с DirectX.

Просто измените свой метод «DrawQuad» следующим образом:

private void DrawQuad(Color aColor, float aAlpha)
{
    aColor.a = aAlpha;
    Texture2D texture = new Texture2D(1, 1);
    texture.SetPixel(0, 0, aColor);
    texture.Apply();
    GUI.skin.box.normal.background = texture;
    GUI.Box(new Rect(0, 0, Screen.width, Screen.height), GUIContent.none);
} 

См. также http://forum.unity3d.com/threads/draw-a-simple-rectangle-filled-with-a-color.116348/

Установите для Graphics API значение Open GL ES 2.0 в настройках проигрывателя. Это может быть связано с новым рендерингом металла iOS, выпущенным с Unity 4.6.3.

Согласно документации для GL.Color, его "можно вызывать только между GL .Begin и GL.End функции". Ваш вызов GL.Color происходит до GL.Begin.