Я работаю с набором данных в Gephi, который получен из таблицы друзей с сайта Buddypress. Я сделал ряд вещей с графом, которые полезны с использованием встроенных функций, но меня интересует лучший алгоритм кластеризации, чем тот, что включен (я использую Force Atlas 2 для размещения узлов). Например, я хотел бы использовать свое свойство модульности для группировки узлов в кластеры. Я попытался загрузить два плагина (Гирвана Ньюмана и алгоритм кластеризации Маркова), но не могу понять, как применить их к моему графику. Они отображаются в окне «кластеризация» рабочего процесса, но когда я их выбираю, кнопка «Выполнить» становится серой. Они также не отображаются в раскрывающемся списке «плагин» в главном пользовательском интерфейсе. Любые идеи?
Кластеризация в Gephi 0.8.2
Ответы (1)
Это немного сложно. Girvan-Newman тоже у меня седеет, но после некоторых перезапусков Gephi мне удалось заставить его работать. Я думаю, что лучше всего закрыть Gephi, а затем открыть ваш .gephi файл из файловой системы, при этом Gephi все еще закрыт.
Если вы не можете запустить алгоритм, попробуйте вычислить из статистики, модульность графа, которая применяет метод обнаружения сообщества Лувена к вашему графу. После модульности или запуска Гирвана-Ньюмана они присваивают каждому узлу номер кластера, который является кластером, к которому они принадлежат.
Затем вы можете раскрасить график, чтобы обозначить различные разделы разными цветами. Это делается через окно Разделение в Gephi.
.
Затем вы можете запустить Force Atlas 2, чтобы расположить кластеры соответствующим образом.
