pystan: distutils.errors.CompileError: команда «gcc» не удалась со статусом выхода 1

Я использую Ubuntu 14.04.3 и последнюю версию Anaconda.

Когда pystan пытается скомпилировать модели, я получаю следующую ошибку:

distutils.errors.CompileError: command 'gcc' failed with exit status 1

Когда я пытаюсь запустить модели на своем сервере RHEL на работе, все работает нормально.

Перед установкой pystan я запустил

apt-get install build-essential

Я пытался установить stan с помощью anaconda и собрать из исходного кода, но все равно получаю ошибку.

Я понятия не имею, что попробовать дальше.

Изменить: полный вывод ошибки ниже

INFO:pystan:COMPILING THE C++ CODE FOR MODEL anon_model_900950b5a4d15a106db93874d106a01d NOW.
Traceback (most recent call last):
  File "schools.py", line 63, in <module>
    main()
  File "schools.py", line 59, in main
    output = fit()
  File "schools.py", line 54, in fit
    res = pystan.stan(model_code=pasted_code(), data=model_data, iter=1000, chains=4)
  File "/home/hahdawg/anaconda/lib/python2.7/site-packages/pystan/api.py", line 373, in stan
    save_dso=save_dso, verbose=verbose)
  File "/home/hahdawg/anaconda/lib/python2.7/site-packages/pystan/model.py", line 319, in __init__
    build_extension.run()
  File "/home/hahdawg/anaconda/lib/python2.7/distutils/command/build_ext.py", line 337, in run
    self.build_extensions()
  File "/home/hahdawg/anaconda/lib/python2.7/distutils/command/build_ext.py", line 446, in build_extensions
    self.build_extension(ext)
  File "/home/hahdawg/anaconda/lib/python2.7/distutils/command/build_ext.py", line 496, in build_extension
    depends=ext.depends)
  File "/home/hahdawg/anaconda/lib/python2.7/distutils/ccompiler.py", line 574, in compile
    self._compile(obj, src, ext, cc_args, extra_postargs, pp_opts)
  File "/home/hahdawg/anaconda/lib/python2.7/distutils/unixccompiler.py", line 122, in _compile
    raise CompileError, msg
distutils.errors.CompileError: command 'gcc' failed with exit status 1

person hahdawg    schedule 25.09.2015    source источник
comment
У вас есть полный вывод ошибки? Вы можете это предоставить?   -  person Thomas Orozco    schedule 25.09.2015


Ответы (1)


Если у кого-то возникла такая же проблема, следующие шаги устранили проблему.

  1. Удалить Анаконду
  2. Установить Анаконду
  3. Установите pystan с помощью pip

Понятия не имею, почему это сработало.

person hahdawg    schedule 25.09.2015