R Markdown Не удалось найти файл .bib в одном проекте, в то время как в другом он работает нормально

Rmd ссылается нормально в файле x, после нажатия кнопки «вязать», добавляя ссылки в мой список ссылок, однако в файле y также файл rmd настроен следующим образом:

title: Swans
bibliography: library.bib
output: html_document


[@Ticehurst1957]
##bibloography

после вязания получаю следующую ошибку и нет вывода

выходной файл: esse_swan_first.knit.md

pandoc-citeproc: не удалось найти library.bib pandoc: ошибка при запуске фильтра /Applications/RStudio.app/Contents/MacOS/pandoc/pandoc-citeproc Ошибка: преобразование документа pandoc не удалось с ошибкой 83.

Что происходит?


r markdown pandoc
person Jamie Dunning    schedule 05.11.2015    source источник
comment
Потенциально проверьте stackoverflow.com/questions/25191744/? Я только что погуглил код ошибки, и это кажется разумным.   -  person Akhil Nair    schedule 05.11.2015
comment
где ваш файл rmarkdown и bib? Возможно, ваш wd не такой, как вы думаете, особенно если вы работаете с проектом Rstudio и вложенными подкаталогами. Вы можете попробовать установить путь к library.bib относительно корня вашего проекта.   -  person scoa    schedule 06.11.2015
comment
@scoa, кажется, сделал свое дело. Передвинул нагрудник. Файл такой же, как мой текущий проект. Спасибо за вашу помощь   -  person Jamie Dunning    schedule 06.11.2015

Ответы (1)


arrow_upward
2
arrow_downward

knitr ожидает, что все пути будут либо абсолютными, либо относительными к вашему текущему рабочему каталогу R. В проекте Rstudio рабочим каталогом является каталог, в котором был создан проект (это можно проверить с помощью getwd()).

Вам нужно либо адаптировать заголовок YAML к:

---
bibliography: /path/to/library.bib
---

Или скопируйте library.bib в папку вашего текущего проекта rstudio.

person scoa    schedule 06.11.2015