[простой вопрос]: импортировать .net файл (слово / вхождения) в cytoscapeКакие атрибуты какие?

Я взял корпус текста и поместил его в VosViewer, чтобы создать для меня сеть. Когда я импортирую этот файл .net в gephi, он работает нормально: я получаю семантическую сеть. Хотя я немного застрял в том, какие атрибуты выбрать для импорта в cytoscape. Вот CSV-файл сети (импорт .net не работает), и мне просто нужно знать, какой столбец выбрать в качестве чего.

Каждый столбец можно импортировать как один из следующих:

  • Исходный узел
  • Тип взаимодействия
  • Атрибут края
  • Атрибут исходного узла
  • Атрибут целевого узла

Атрибуты файла CSV


nlp cytoscape text-processing
person Community    schedule 16.03.2016    source источник

Ответы (2)


arrow_upward
0
arrow_downward

Как вариант, вы можете экспортировать вашу сеть из Gephi в формат GraphML, а затем загрузить ее из Cytoscape. Это позволит вам забыть о кровавых деталях конверсии.

Просто перейдите к File>Export>Graph file и выберите GraphML под параметром Тип файлов:

person Yannis P.    schedule 18.03.2016

arrow_upward
0
arrow_downward

Это формат .net, который вы используете? https://gephi.org/users/supported-graph-formats/pajek-net-format/

Если это так, то вы можете видеть, что формат (как и любой формат сетевого файла) требует как минимум двух столбцов идентификаторов узлов, то есть источника и цели. На вашем снимке экрана четко показаны «id» первых столбцов вместе с некоторыми атрибутами узла. Заголовки столбцов для «веса» и «кластера» не так понятны. Мое наивное предположение состоит в том, что столбец «вес (совпадения)» на самом деле является вторым списком идентификаторов «целевых» узлов, а «вес (совпадения)» - это атрибут края. Но это только предположение!

Если вы можете определить значение столбцов в вашем файле, то просто назначить и импортировать их в Cytoscape для .net или в любой другой формат файла tabluar.

Надеюсь это поможет!

person AlexanderPico    schedule 17.03.2016