Обоснование онтологии с использованием OWL API

Я использовал OWL API 4.1.3 для загрузки своей небольшой онтологии. Поскольку мне нужно использовать предполагаемую информацию, я также провел рассуждения, используя библиотеку Hermit 1.3.8.413. Следующий код показывает, как я это сделал.

public class ReasonRDF {

public static void main(String[] args) throws OWLOntologyCreationException, OWLOntologyStorageException {

    readRDF("C:/Users/workspace/Ontology_matching/NVDB_Matching_v18_H_4_1_CONVERTYING/results/NewInstantiated/owl/OSM1.owl");

}
public static void readRDF(String address) throws OWLOntologyCreationException, OWLOntologyStorageException{
    OWLOntologyManager manager =OWLManager.createOWLOntologyManager();
    File file = new File (address);
    OWLOntology ont = manager.loadOntologyFromOntologyDocument(IRI.create(file));
    System.out.println("Ontology Loaded...");

    System.out.println("Logical IRI   : " + ont.getOntologyID());
    System.out.println("Format        : " + manager.getOntologyFormat(ont));
    System.out.println("Runtime memory: " + Runtime.getRuntime().totalMemory());      
      ReasonerFactory reasonerFactory = new ReasonerFactory();
      ConsoleProgressMonitor progressMonitor = new ConsoleProgressMonitor();
      Configuration config = new Configuration();
      config.ignoreUnsupportedDatatypes=true;
      config.reasonerProgressMonitor= progressMonitor;
      OWLReasoner reasoner = reasonerFactory.createReasoner(ont, config);


      long t0 = System.nanoTime();

      System.out.println("Starting to add axiom generators");
      OWLDataFactory datafactory = manager.getOWLDataFactory();
      List<InferredAxiomGenerator<? extends OWLAxiom>> inferredAxioms = new ArrayList<InferredAxiomGenerator<? extends OWLAxiom>>();
      //inferredAxioms.add(new InferredSubClassAxiomGenerator());
      inferredAxioms.add(new InferredClassAssertionAxiomGenerator());
      //inferredAxioms.add(new InferredDataPropertyCharacteristicAxiomGenerator());
      //inferredAxioms.add(new InferredObjectPropertyCharacteristicAxiomGenerator());
      //inferredAxioms.add(new InferredEquivalentClassAxiomGenerator());
      //inferredAxioms.add(new InferredPropertyAssertionGenerator());
      //inferredAxioms.add(new InferredInverseObjectPropertiesAxiomGenerator());         
      inferredAxioms.add(new InferredSubDataPropertyAxiomGenerator());
      inferredAxioms.add(new InferredSubObjectPropertyAxiomGenerator());
      System.out.println("finished adding axiom generators");

//        List<InferredIndividualAxiomGenerator<? extends OWLIndividualAxiom>> individualAxioms= new ArrayList<InferredIndividualAxiomGenerator<? extends OWLIndividualAxiom>>();
//        inferredAxioms.addAll(individualAxioms);

    // for writing inferred axioms to the new ontology
    OWLOntology infOnt = manager.createOntology(IRI.create(ont.getOntologyID().getOntologyIRI().get()+"_inferred"));

      // use generator and reasoner to infer some axioms
      System.out.println("Starting to infer");
      InferredOntologyGenerator iog = new InferredOntologyGenerator(reasoner, inferredAxioms);
      //InferredOntologyGenerator iog = new InferredOntologyGenerator(reasoner);

      System.out.println("Inferrence is over");

      System.out.println("Storing the results");
      iog.fillOntology(datafactory,infOnt);
      System.out.println("Results are stored");
      long elapsed_time = System.nanoTime()-t0;
      System.out.println(elapsed_time);

      // save the ontology
      manager.saveOntology(infOnt, IRI.create("file:///C:/Users/ontologies/NVDB4_test.rdf"));
    }
}

Он не выдает никаких ошибок, но для сохранения выведенной онтологии в новом файле требуется вечность. На самом деле он не завершает работу даже через 2 дня. Моя IDE — eclipse EE, и я выделил от 6 до 12 ГБ памяти для запуска этого приложения. Я не могу найти никаких проблем с моим кодом или моей онтологией.

Может ли кто-нибудь предложить оптимизацию или, может быть, даже лучший способ реализации или другой API?

вот моя онтология на случай, если кто-то захочет ее протестировать.