JanusGraph 0.2.0 Spark не удалось подключиться к мастеру

Когда я использую пример из главы 35 документации JanusGraph 0.2.0, все в порядке. Но когда я меняю spark.master в conf / hadoop-graph / hadoop-load.properties с local [*] на spark: //192.168.63.105: 7077, я получаю некоторую предупреждающую информацию.

В главе 35 документации JanusGraph 0.2.0 есть примечание: пример в этой главе основан на запуске Spark в локальном режиме. Дополнительная настройка требуется при использовании Spark в автономном режиме или при запуске Spark на Yarn или Mesos. Что такое дополнительная конфигурация?

Информация о предупреждении:

> WARN org.apache.tinkerpop.gremlin.spark.process.computer.SparkGraphComputer - class org.apache.hadoop.mapreduce.lib.output.NullOutputFormat does not implement PersistRequestGraphAware and thus, persistence options are unknown -- assuming all options are possible

> WARN org.apache.spark.deploy.client.AppClient$ClientEndpoint - Failed to connect to master 192.168.63.105:7077

> java.lang.RuntimeException: java.io.EOFException
> at java.io.DataInputStream.readFully(DataInputStream.java:197)
> at java.io.DataInputStream.readUTF(DataInputStream.java:609) 
> at java.io.DataInputStream.readFully(DataInputStream.java:564) 
> at org.apache.spark.rpc.netty.RequestMessage$.readRpcAddress(NettyRpcEnv.scala:582)
> at org.apache.spark.rpc.netty.RequestMessage$.apply(NettyRpcEnv.scala:592)
> at org.apache.spark.rpc.netty.NettyRpcHandler.internalReceive(NettyRpcEnv.scala:651)
> at org.apache.spark.rpc.netty.NettyRpcHandler.receive(NettyRpcEnv.scala:636)
> at org.apache.spark.network.server.TransportRequestHandler.processRpcRequest(TransportRequestHandler.java:157)
> at org.apache.spark.network.server.TransportRequestHandler.handle(TransportRequestHandler.java:105)
> at org.apache.spark.network.server.TransportChannelHandler.channelRead(TransportChannelHandler.java:118)
> at io.netty.channel.AbstractChannelHandlerContext.invokeChannelRead(AbstractChannelHandlerContext.java:357)
> at io.netty.channel.AbstractChannelHandlerContext.invokeChannelRead(AbstractChannelHandlerContext.java:343)
> at io.netty.channel.AbstractChannelHandlerContext.fireChannelRead(AbstractChannelHandlerContext.java:336)
> at io.netty.handler.timeout.IdleStateHandler.channelRead(IdleStateHandler.java:287)
> at io.netty.channel.AbstractChannelHandlerContext.invokeChannelRead(AbstractChannelHandlerContext.java:357)
> at io.netty.channel.AbstractChannelHandlerContext.invokeChannelRead(AbstractChannelHandlerContext.java:343)
> at io.netty.channel.AbstractChannelHandlerContext.fireChannelRead(AbstractChannelHandlerContext.java:336)
> at io.netty.handler.codec.MessageToMessageDecoder.channelRead(MessageToMessageDecoder.java:102)
> at io.netty.channel.AbstractChannelHandlerContext.invokeChannelRead(AbstractChannelHandlerContext.java:357)
> at io.netty.channel.AbstractChannelHandlerContext.invokeChannelRead(AbstractChannelHandlerContext.java:343)
> at io.netty.channel.AbstractChannelHandlerContext.fireChannelRead(AbstractChannelHandlerContext.java:336)
> at org.apache.spark.network.util.TransportFrameDecoder.channelRead(TransportFrameDecoder.java:85)
> at io.netty.channel.AbstractChannelHandlerContext.invokeChannelRead(AbstractChannelHandlerContext.java:357)
> at io.netty.channel.AbstractChannelHandlerContext.invokeChannelRead(AbstractChannelHandlerContext.java:343)
> at io.netty.channel.AbstractChannelHandlerContext.fireChannelRead(AbstractChannelHandlerContext.java:336)
> at io.netty.channel.DefaultChannelPipeline$HeadContext.channelRead(DefaultChannelPipeline.java:1294)
> at io.netty.channel.AbstractChannelHandlerContext.invokeChannelRead(AbstractChannelHandlerContext.java:357)
> at io.netty.channel.AbstractChannelHandlerContext.invokeChannelRead(AbstractChannelHandlerContext.java:343)
> at io.netty.channel.DefaultChannelPipeline.fireChannelRead(DefaultChannelPipeline.java:911)
> at io.netty.channel.nio.AbstractNioByteChannel$NioByteUnsafe.read(AbstractNioByteChannel.java:131)
> at io.netty.channel.nio.NioEventLoop.processSelectedkey(NioEventLoop.java:643) 
> at io.netty.channel.nio.NioEventLoop.processSelectedkeyOptimized(NioEventLoop.java:566)
> at io.netty.channel.nio.NioEventLoop.processSelectedkey(NioEventLoop.java:480)
> at io.netty.channel.nio.NioEventLoop.run(NioEventLoop.java:442)
> at io.netty.util.concurrent.SingleThreadEventExecutor$2.run(SingleThreadEventExecutor.java:131)
> at io.netty.util.concurrent.DefaultThreadFactory$DefaultRunnableDecorator.run(DefaultThreadFactory.java:144)
> at java.lang.Thread.run(Thread.java:745)

> at org.apache.spark.network.client.TransportResponseHandler.handle(TransportResponseHandler.java:186)
> at org.apache.spark.network.server.TransportChannelHandler.channelRead0(TransportChannelHandler.java:106)
> at org.apache.spark.network.server.TransportChannelHandler.channelRead0(TransportChannelHandler.java:51)
> at io.netty.channel.SimpleChannelInboundHandler.channelRead(SimpleChannelInboundHandler.java:105)
> at io.netty.channel.AbstractChannelHandlerContext.invokeChannelRead(AbstractChannelHandlerContext.java:356)
> at io.netty.channel.AbstractChannelHandlerContext.invokeChannelRead(AbstractChannelHandlerContext.java:342)
> at io.netty.channel.AbstractChannelHandlerContext.fireChannelRead(AbstractChannelHandlerContext.java:335)
> at io.netty.handler.timeout.IdleStateHandler.channelRead(IdleStateHandler.java:286)
> at io.netty.channel.AbstractChannelHandlerContext.invokeChannelRead(AbstractChannelHandlerContext.java:356)
> at io.netty.channel.AbstractChannelHandlerContext.invokeChannelRead(AbstractChannelHandlerContext.java:342)
> at io.netty.channel.AbstractChannelHandlerContext.fireChannelRead(AbstractChannelHandlerContext.java:335)
> at io.netty.handler.codec.MessageToMessageDecoder.channelRead(MessageToMessageDecoder.java:102)
> at io.netty.channel.AbstractChannelHandlerContext.invokeChannelRead(AbstractChannelHandlerContext.java:356)
> at io.netty.channel.AbstractChannelHandlerContext.invokeChannelRead(AbstractChannelHandlerContext.java:342)
> at io.netty.channel.AbstractChannelHandlerContext.fireChannelRead(AbstractChannelHandlerContext.java:335)
> at org.apache.spark.network.util.TransportFrameDecoder.channelRead(TransportFrameDecoder.java:86)
> at io.netty.channel.AbstractChannelHandlerContext.invokeChannelRead(AbstractChannelHandlerContext.java:356)
> at io.netty.channel.AbstractChannelHandlerContext.invokeChannelRead(AbstractChannelHandlerContext.java:342)
> at io.netty.channel.AbstractChannelHandlerContext.fireChannelRead(AbstractChannelHandlerContext.java:335)
> at io.netty.channel.DefaultChannelPipeline$HeadContext.channelRead(DefaultChannelPipeline.java:1302)
> at io.netty.channel.AbstractChannelHandlerContext.invokeChannelRead(AbstractChannelHandlerContext.java:356)
> at io.netty.channel.AbstractChannelHandlerContext.invokeChannelRead(AbstractChannelHandlerContext.java:342)
> at io.netty.channel.DefaultChannelPipeline.fireChannelRead(DefaultChannelPipeline.java:919)
> at io.netty.channel.nio.AbstractNioByteChannel$NioByteUnsafe.read(AbstractNioByteChannel.java:131)
> at io.netty.channel.nio.NioEventLoop.processSelectedkey(NioEventLoop.java:646)
> at io.netty.channel.nio.NioEventLoop.processSelectedkeyOptimized(NioEventLoop.java:581)
> at io.netty.channel.nio.NioEventLoop.processSelectedkey(NioEventLoop.java:498)
> at io.netty.channel.nio.NioEventLoop.run(NioEventLoop.java:460)
> at io.netty.util.concurrent.SingleThreadEventExecutor$2.run(SingleThreadEventExecutor.java:131)
> at java.lang.Thread.run(Thread.java:745)

Мой файл конфигурации - conf / janusgraph-hbase-es-test-spark.properties, содержимое которого следующее:

storage.backend=hbase
storage.hostname=192.168.63.105,192.168.63.107,192.168.63.109
storage.hbase.ext.hbase.zookeeper.property.clientPort=2181
storage.hbase.table=janus_test_spark_7077
gremlin.graph=org.janusgraph.core.JanusGraphFactory
cache.db-cache=true
cache.db-cache-clean-wait=20
cache.db-cache-time=18000
cache.db-cache-size=0.5
index.search.backend=elasticsearch
index.search.hostname=192.168.63.105,192.168.63.107,192.168.63.109
index.search.elasticsearch.client-only=true

Я использую искровую версию spark-2.2.0-bin-hadoop2.7.

Я также пробую spark-1.6.0-bin-hadoop2.6, информация о предупреждении следующая:

WARN org.apache.spark.scheduler.TaskSetManager - Lost task 0.0 in stage 0.0 (TID 0, SparkWorker109): java.io.InvalidClassException: org.apache.spark.rdd.MapPartitionsRDD; local class incompatible: stream classdesc serialVersionUID=6732270565076291202, local class SerialVersionUID=-1059539896677275380

at java.io.ObjectStreamClass.initNonProxy(ObjectStreamClass.java:616)
at java.io.ObjectInputStream.readNonProxyDesc(ObjectInputStream.java:1630)
at java.io.ObjectInputStream.readClassDesc(ObjectInputStream.java:1521)
at java.io.ObjectInputStream.readOrdinaryObject(ObjectInputStream.java:1781)
at java.io.ObjectInputStream.readObject0(ObjectInputStream.java:1353)
at java.io.ObjectInputStream.defaultReadFields(ObjectInputStream.java:2018)
at java.io.ObjectInputStream.readSerialData(ObjectInputStream.java:1942)
at java.io.ObjectInputStream.readOrdinaryObject(ObjectInputStream.java:1808)
at java.io.ObjectInputStream.readObject0(ObjectInputStream.java:1353)
at java.io.ObjectInputStream.readObject(ObjectInputStream.java:373)
at org.apache.spark.serializer:JavaDeserializationStream.readObject(JavaSerializer.scala:76)
at org.apache.spark.serializer:JavaSerializerInstance.deserialize(JavaSerializer.scala:115)
at org.apache.spark.scheduler.ShuffleMapTask.runTask(ShuffleMapTask.scala:64)
at org.apache.spark.scheduler.ShuffleMapTask.runTask(ShuffleMapTask.scala:41)
at org.apache.spark.scheduler.Task.run(Task.scala:89)
at org.apache.spark.executor.Executor$TaskRunner.run(Executor.scala:213)
at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor.runWorker(ThreadPoolExecutor.java:1142)
at java.util.concurrent.ThreadPoolExecutor$Worker.run(ThreadPoolExecutor.java:617)
at java.lang.Thread.run(Thread.java:745)

Спасибо за внимание и помощь.


person fromnowon    schedule 29.10.2017    source источник
comment
Проблема заключается в версии Spark, которую использует JanusGraph, и той, которую вы использовали для запуска автономного кластера. Какую версию Spark вы использовали? Я заметил, что был выпущен JanusGraph 0.2.0. Можете ли вы проверить, решает ли это вашу проблему?   -  person Jacek Laskowski    schedule 29.10.2017
comment
Спасибо за Ваш ответ. Я использую spark-1.6.0-bin-hadoop2.6, spark-2.1.1-bin-hadoop2.7 и spark-2.2.0-bin-hadoop2.7 отдельно, информация об ошибках такая же. Но когда я использую JanusGraph 0.2.0, я встречаю другой вопрос, а именно gremlin ›hdfs.ls (), я получаю информацию об ошибке: org.apache.hadoop.hdfs.protocol.proto.ClientNamenodeProtocolProto $ GetFileInfoRequestProto не может быть преобразован в com .google.protobuf.Message.   -  person fromnowon    schedule 30.10.2017
comment
Я знаю причину ошибки при запуске gremlin ›hdfs.ls () в JanusGraph 0.2.0, то есть в JanusGraph-0.2.0-hadoop2 / lib / нет hadoop-hdfs-2.7.2.jar. Но я все еще не могу подключиться к spark.master, который является spark: //192.168.63.105: 7077   -  person fromnowon    schedule 01.11.2017


Ответы (1)


Вот мой hadoop-load.properties.

#
# SparkGraphComputer Configuration
#
spark.master=yarn-client
spark.executor.memory=512m
spark.serializer=org.apache.spark.serializer.KryoSerializer
spark.app.name=janusgraph-data-load
spark.app.id=janusgraph-data-load
spark.executor.extraClassPath=/opt/janusgraph-lib/*:/etc/hadoop/conf:/etc/hbase/conf:/etc/spark/conf
#hdp version
spark.yarn.am.extraJavaOptions=-Dhdp.version=2.6.1.0-129
spark.executor.extraJavaOptions=-Dhdp.version=2.6.1.0-129
spark.driver.extraJavaOptions=-Dhdp.version=2.6.1.0-129
person JasonWang    schedule 21.11.2017