Вот лучшая версия моего предыдущего вопроса: у меня есть набор данных о матерях (mid
), детях (id
), рождении (born
), смерти (dead
) и дате свадьбы (Marriage_Date
) этих детей. ord
указывает порядок рождения, tstart
и tstop
год въезда, выезда лица, находящегося под наблюдением. tstart3
и tstop3
обозначают возраст человека в каждый интервал наблюдения. время наблюдения указано в формате анализа выживания, то есть оно сокращается каждый год (сокращается по периодам).
Из детей я хочу создать один столбец с изменяющимся во времени числом старших братьев и сестер, если возможно, мужчин и женщин отдельно, которые живы, когда эго (id
) находится под наблюдением (и, следовательно, когда он или она женится - что событие моего анализа). Сам фрейм данных изменять не следует, так как это необходимый формат для анализа выживаемости. что должно измениться, так это количество братьев и сестер, живущих в tstop для каждого человека. Если родной брат рождается у уже существующего ребенка, новый столбец старшие братья и сестры получает +1, следующий плюс один добавляется до тех пор, пока идентификатор матери снова не изменится. если родной брат умирает, - 1 до рождения следующего.
Итак, на мой взгляд, решение должно быть чем-то вроде цикла for, который группируется по mid
(и id
?)
Вот извлечение данных в формате dput:
structure(list(id = c("1799939", "1799939", "1799939", "1799939",
"1799939", "1799939", "1799939", "1132576", "1132576", "1132576",
"1132576", "1132576", "1132576", "1132576", "1132576", "1112778",
"1112778", "1112778", "1112778", "1112778", "1112778", "1112778",
"1112778", "1112778", "1667687", "1667687", "1667687", "1667687",
"1667687", "1667687", "1667687", "1667687", "1667687", "1667687",
"1667687", "1667687", "1667687", "1667687", "1667687", "1667687",
"1667687", "1667687", "1667687", "1667687", "1667687", "1667687",
"1667687", "1667687", "1667687", "1667687", "1667687", "1667687",
"1667687", "1667687", "1667687", "1667687", "1667687", "1933509",
"1933509", "1933509", "1933509", "1933509", "1933509", "1933509",
"1933509", "1933509", "1097672", "1097672", "1097672", "1097672",
"1097672", "1097672", "1097672", "1097672", "1097672", "1097672",
"1097672", "1097672", "1097672", "1097672", "1039958", "1039958",
"1039958", "1039958", "1039958", "1039958", "1039958"), mid = c("1004212",
"1004212", "1004212", "1004212", "1004212", "1004212", "1004212",
"1004212", "1004212", "1004212", "1004212", "1004212", "1004212",
"1004212", "1004212", "1004212", "1004212", "1004212", "1004212",
"1004212", "1004212", "1004212", "1004212", "1004212", "1004212",
"1004212", "1004212", "1004212", "1004212", "1004212", "1004212",
"1004212", "1004212", "1004212", "1004212", "1004212", "1004212",
"1004212", "1004212", "1004212", "1004212", "1004212", "1004212",
"1004212", "1004212", "1004212", "1004212", "1004212", "1004212",
"1004212", "1004212", "1004212", "1004212", "1004212", "1004212",
"1004212", "1004212", "1004212", "1004212", "1004212", "1004212",
"1004212", "1004212", "1004212", "1004212", "1004212", "1004212",
"1004212", "1004212", "1004212", "1004212", "1004212", "1004212",
"1004212", "1004212", "1004212", "1004212", "1004212", "1004212",
"1004212", "1004241", "1004241", "1004241", "1004241", "1004241",
"1004241", "1004241"), born = c(1813.5698630137, 1813.5698630137,
1813.5698630137, 1813.5698630137, 1813.5698630137, 1813.5698630137,
1813.5698630137, 1815.48767123288, 1815.48767123288, 1815.48767123288,
1815.48767123288, 1815.48767123288, 1815.48767123288, 1815.48767123288,
1815.48767123288, 1818.01095890411, 1818.01095890411, 1818.01095890411,
1818.01095890411, 1818.01095890411, 1818.01095890411, 1818.01095890411,
1818.01095890411, 1818.01095890411, 1820.2131147541, 1820.2131147541,
1820.2131147541, 1820.2131147541, 1820.2131147541, 1820.2131147541,
1820.2131147541, 1820.2131147541, 1820.2131147541, 1820.2131147541,
1820.2131147541, 1820.2131147541, 1820.2131147541, 1820.2131147541,
1820.2131147541, 1820.2131147541, 1820.2131147541, 1820.2131147541,
1820.2131147541, 1820.2131147541, 1820.2131147541, 1820.2131147541,
1820.2131147541, 1820.2131147541, 1820.2131147541, 1820.2131147541,
1820.2131147541, 1820.2131147541, 1820.2131147541, 1820.2131147541,
1820.2131147541, 1820.2131147541, 1820.2131147541, 1824.33333333333,
1824.33333333333, 1824.33333333333, 1824.33333333333, 1824.33333333333,
1824.33333333333, 1824.33333333333, 1824.33333333333, 1824.33333333333,
1826.89589041096, 1826.89589041096, 1826.89589041096, 1826.89589041096,
1826.89589041096, 1826.89589041096, 1826.89589041096, 1826.89589041096,
1826.89589041096, 1826.89589041096, 1826.89589041096, 1826.89589041096,
1826.89589041096, 1826.89589041096, 1828.28142076503, 1828.28142076503,
1828.28142076503, 1828.28142076503, 1828.28142076503, 1828.28142076503,
1828.28142076503), dead = c(1863.97808219178, 1863.97808219178,
1863.97808219178, 1863.97808219178, 1863.97808219178, 1863.97808219178,
1863.97808219178, 1844.07103825137, 1844.07103825137, 1844.07103825137,
1844.07103825137, 1844.07103825137, 1844.07103825137, 1844.07103825137,
1844.07103825137, 1890.85205479452, 1890.85205479452, 1890.85205479452,
1890.85205479452, 1890.85205479452, 1890.85205479452, 1890.85205479452,
1890.85205479452, 1890.85205479452, 1871.81643835616, 1871.81643835616,
1871.81643835616, 1871.81643835616, 1871.81643835616, 1871.81643835616,
1871.81643835616, 1871.81643835616, 1871.81643835616, 1871.81643835616,
1871.81643835616, 1871.81643835616, 1871.81643835616, 1871.81643835616,
1871.81643835616, 1871.81643835616, 1871.81643835616, 1871.81643835616,
1871.81643835616, 1871.81643835616, 1871.81643835616, 1871.81643835616,
1871.81643835616, 1871.81643835616, 1871.81643835616, 1871.81643835616,
1871.81643835616, 1871.81643835616, 1871.81643835616, 1871.81643835616,
1871.81643835616, 1871.81643835616, 1871.81643835616, 1902.33150684932,
1902.33150684932, 1902.33150684932, 1902.33150684932, 1902.33150684932,
1902.33150684932, 1902.33150684932, 1902.33150684932, 1902.33150684932,
1862.01643835616, 1862.01643835616, 1862.01643835616, 1862.01643835616,
1862.01643835616, 1862.01643835616, 1862.01643835616, 1862.01643835616,
1862.01643835616, 1862.01643835616, 1862.01643835616, 1862.01643835616,
1862.01643835616, 1862.01643835616, 1852.22950819672, 1852.22950819672,
1852.22950819672, 1852.22950819672, 1852.22950819672, 1852.22950819672,
1852.22950819672), Marriage_Date = c(1837.8602739726, 1837.8602739726,
1837.8602739726, 1837.8602739726, 1837.8602739726, 1837.8602739726,
1837.8602739726, 1838.3397260274, 1838.3397260274, 1838.3397260274,
1838.3397260274, 1838.3397260274, 1838.3397260274, 1838.3397260274,
1838.3397260274, 1844.91256830601, 1844.91256830601, 1844.91256830601,
1844.91256830601, 1844.91256830601, 1844.91256830601, 1844.91256830601,
1844.91256830601, 1844.91256830601, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA,
NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA,
NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA, 1850.10684931507, 1850.10684931507,
1850.10684931507, 1850.10684931507, 1850.10684931507, 1850.10684931507,
1850.10684931507, 1850.10684931507, 1850.10684931507, 1857.06301369863,
1857.06301369863, 1857.06301369863, 1857.06301369863, 1857.06301369863,
1857.06301369863, 1857.06301369863, 1857.06301369863, 1857.06301369863,
1857.06301369863, 1857.06301369863, 1857.06301369863, 1857.06301369863,
1857.06301369863, NA, NA, NA, NA, NA, NA, NA), start3 = c(0,
0.430136986301477, 1.43013698630148, 2.43013698630148, 3.43013698630148,
4.43013698630148, 5.43013698630148, 0, 0.512328767123336, 1.51232876712334,
2.51232876712334, 3.51232876712334, 4.51232876712334, 6.51232876712334,
5.51232876712334, 0, 0.989041095890343, 1.98904109589034, 2.98904109589034,
3.98904109589034, 4.98904109589034, 5.98904109589034, 6.98904109589034,
7.98904109589034, 0, 0.786885245901658, 1.78688524590166, 2.78688524590166,
3.78688524590166, 4.78688524590166, 5.78688524590166, 6.78688524590166,
7.78688524590166, 8.78688524590166, 9.78688524590166, 10.7868852459017,
11.7868852459017, 12.7868852459017, 13.7868852459017, 14.7868852459017,
15.7868852459017, 16.7868852459017, 17.7868852459017, 18.7868852459017,
19.7868852459017, 20.7868852459017, 21.7868852459017, 22.7868852459017,
23.7868852459017, 24.7868852459017, 25.7868852459017, 26.7868852459017,
27.7868852459017, 28.7868852459017, 29.7868852459017, 30.7868852459017,
31.7868852459017, 0, 0.666666666666742, 1.66666666666674, 2.66666666666674,
3.66666666666674, 4.66666666666674, 5.66666666666674, 6.66666666666674,
7.66666666666674, 0, 0.104109589041173, 1.10410958904117, 2.10410958904117,
3.10410958904117, 4.10410958904117, 5.10410958904117, 6.10410958904117,
7.10410958904117, 8.10410958904117, 9.10410958904117, 10.1041095890412,
12.1041095890412, 11.1041095890412, 0, 0.718579234972594, 1.71857923497259,
2.71857923497259, 3.71857923497259, 5.71857923497259, 4.71857923497259
), stop3 = c(0.430136986301477, 1.43013698630148, 2.43013698630148,
3.43013698630148, 4.43013698630148, 5.43013698630148, 6.2904109589042,
0.512328767123336, 1.51232876712334, 2.51232876712334, 3.51232876712334,
4.51232876712334, 5.51232876712334, 6.85205479452065, 6.51232876712334,
0.989041095890343, 1.98904109589034, 2.98904109589034, 3.98904109589034,
4.98904109589034, 5.98904109589034, 6.98904109589034, 7.98904109589034,
8.90160940190117, 0.786885245901658, 1.78688524590166, 2.78688524590166,
3.78688524590166, 4.78688524590166, 5.78688524590166, 6.78688524590166,
7.78688524590166, 8.78688524590166, 9.78688524590166, 10.7868852459017,
11.7868852459017, 12.7868852459017, 13.7868852459017, 14.7868852459017,
15.7868852459017, 16.7868852459017, 17.7868852459017, 18.7868852459017,
19.7868852459017, 20.7868852459017, 21.7868852459017, 22.7868852459017,
23.7868852459017, 24.7868852459017, 25.7868852459017, 26.7868852459017,
27.7868852459017, 28.7868852459017, 29.7868852459017, 30.7868852459017,
31.7868852459017, 32, 0.666666666666742, 1.66666666666674, 2.66666666666674,
3.66666666666674, 4.66666666666674, 5.66666666666674, 6.66666666666674,
7.66666666666674, 7.77351598173527, 0.104109589041173, 1.10410958904117,
2.10410958904117, 3.10410958904117, 4.10410958904117, 5.10410958904117,
6.10410958904117, 7.10410958904117, 8.10410958904117, 9.10410958904117,
10.1041095890412, 11.1041095890412, 12.1671232876713, 12.1041095890412,
0.718579234972594, 1.71857923497259, 2.71857923497259, 3.71857923497259,
4.71857923497259, 5.94808743169392, 5.71857923497259), ord = c("1",
"1", "1", "1", "1", "1", "1", "2", "2", "2", "2", "2", "2", "2",
"2", "3", "3", "3", "3", "3", "3", "3", "3", "3", "4", "4", "4",
"4", "4", "4", "4", "4", "4", "4", "4", "4", "4", "4", "4", "4",
"4", "4", "4", "4", "4", "4", "4", "4", "4", "4", "4", "4", "4",
"4", "4", "4", "4", "6", "6", "6", "6", "6", "6", "6", "6", "6",
"7", "7", "7", "7", "7", "7", "7", "7", "7", "7", "7", "7", "7",
"7", "1", "1", "1", "1", "1", "1", "1"), tstart = c(1831.5698630137,
1832, 1833, 1834, 1835, 1836, 1837, 1831.48767123288, 1832, 1833,
1834, 1835, 1836, 1838, 1837, 1836.01095890411, 1837, 1838, 1839,
1840, 1841, 1842, 1843, 1844, 1838.2131147541, 1839, 1840, 1841,
1842, 1843, 1844, 1845, 1846, 1847, 1848, 1849, 1850, 1851, 1852,
1853, 1854, 1855, 1856, 1857, 1858, 1859, 1860, 1861, 1862, 1863,
1864, 1865, 1866, 1867, 1868, 1869, 1870, 1842.33333333333, 1843,
1844, 1845, 1846, 1847, 1848, 1849, 1850, 1844.89589041096, 1845,
1846, 1847, 1848, 1849, 1850, 1851, 1852, 1853, 1854, 1855, 1857,
1856, 1846.28142076503, 1847, 1848, 1849, 1850, 1852, 1851),
tstop = c(1832, 1833, 1834, 1835, 1836, 1837, 1837.8602739726,
1832, 1833, 1834, 1835, 1836, 1837, 1838.3397260274, 1838,
1837, 1838, 1839, 1840, 1841, 1842, 1843, 1844, 1844.91256830601,
1839, 1840, 1841, 1842, 1843, 1844, 1845, 1846, 1847, 1848,
1849, 1850, 1851, 1852, 1853, 1854, 1855, 1856, 1857, 1858,
1859, 1860, 1861, 1862, 1863, 1864, 1865, 1866, 1867, 1868,
1869, 1870, 1870.2131147541, 1843, 1844, 1845, 1846, 1847,
1848, 1849, 1850, 1850.10684931507, 1845, 1846, 1847, 1848,
1849, 1850, 1851, 1852, 1853, 1854, 1855, 1856, 1857.06301369863,
1857, 1847, 1848, 1849, 1850, 1851, 1852.22950819672, 1852
)), .Names = c("id", "mid", "born", "dead", "Marriage_Date",
"start3", "stop3", "ord", "tstart", "tstop"), row.names = c(NA,
-87L), class = c("grouped_df", "tbl_df", "tbl", "data.frame"), vars = c("mid",
"id"), drop = TRUE, indices = list(66:79, 15:23, 7:14, 24:56,
0:6, 57:65, 80:86), group_sizes = c(14L, 9L, 8L, 33L, 7L,
9L, 7L), biggest_group_size = 33L, labels = structure(list(mid = c("1004212",
"1004212", "1004212", "1004212", "1004212", "1004212", "1004241"
), id = c("1097672", "1112778", "1132576", "1667687", "1799939",
"1933509", "1039958")), row.names = c(NA, -7L), class = "data.frame", vars = c("mid",
"id"), drop = TRUE, .Names = c("mid", "id")))
Одним из моих многочисленных испытаний было следующее:
fam <- fam[
with(fam, order(mid, ord)),
]
#fam <- fam[ which(fam$mid > 1004211 & fam$mid < 1004246 ) ,]
fam <- group_by(fam, mid, id)
for(i in 1:nrow(fam)){
fam$older_sibs_alive[i] <- length(which(fam$mid==fam$mid[i]) & fam$id==fam$id[i] & lag(fam$dead) < fam$Marriage_Date[i])
}
Конечно, не то, что я хочу.
Есть ли кто-нибудь, у кого есть решение? Большое спасибо.
rank
каждого человека по возрасту среди братьев и сестер в каждом поперечном сечении (т.е.by
семья, время). Я не за компьютером, но вы должны найти ответы, выполнив поиск по рангу по группе r - person MichaelChirico   schedule 22.12.2017