EntityManager внедряет передовой опыт

CDI — это стандартная технология внедрения зависимостей в Java EE и это делает удобным создание производителя метода для EntityManager, тогда вы можете просто внедрить его в свои bean-компоненты.

Аннотация @PersistenceContext имеет ряд настраиваемых элементов ( например name), и вы например, может не хотеться дублировать их по всему приложению.

Внедрение CDI особенно полезно, когда у вас есть несколько единиц сохраняемости. Затем вы можете воспользоваться квалификаторами CDI для внедрения:

public class Databases {

    @Produces @Users 
    @PersistenceContext(unitName="UserData")
    EntityManager userEntityManager;

    @Produces @Documents
    @PersistenceContext(unitName="DocumentData")
    EntityManager docDatabaseEntityManager;
}

@Inject @Users
EntityManager em;

@Inject @Documents
EntityManager em;