Онтология с нетаксономическими отношениями

доброе утро,

Цель моей работы — построить модульные онтологии с нетаксономическими отношениями.

У меня есть некоторые проблемы с записью их в файле owl (я не могу визуализировать отношения между классом и ограничениями).

Я новичок в области онтологии, поэтому я хочу взять пример из существующих онтологий, чтобы увидеть, как определяются нетаксономические отношения.

Однако только те, кого я знаю, это MeSH и GENE, и они используют только таксономические отношения. Итак, есть ли в Интернете какие-либо известные онтологии, использующие нетаксономические?

Спасибо.


taxonomy ontology
person safé    schedule 13.05.2011    source источник

Ответы (4)


arrow_upward
5
arrow_downward

Одной из наиболее известных плоских (иерархически) онтологий является ConceptNet. Это база знаний здравого смысла, созданная сообществом. Это один из проектов Common Sense Computing Initiatives в MIT Media Lab.

Следующее изображение представляет собой небольшое подмножество узлов и ссылок в ConceptNet: Это изображение взято с веб-сайта ConceptNet

person William Niu    schedule 14.05.2011

arrow_upward
2
arrow_downward

Если под не таксономическими вы имеете в виду не только отношения подклассов или какое-то отношение is-a, искали ли вы dbpedia или музыкальная онтология

Или что именно вы имеете в виду под «нетаксономическими отношениями»?

person florent    schedule 13.05.2011
comment
Под нетаксономическим я подразумеваю отсутствие иерархии между классами, все они эквивалентны. Итак, у меня не будет подклассов и суперклассов, а также отношений is-a, чтобы было понятнее, моя онтология будет построена из разделенных предложений: например, рак груди влияет на женщин, моими классами будут рак груди и женщины и отношения между ними. будут аффекты. На данный момент единственное, над чем я бьюсь, это сделать ограничение в этом отношении, и я думаю, что если я увижу пример того, что я хочу сделать, может быть, я смогу найти свою проблему. - person safé; 13.05.2011
comment
вы можете фильтровать нетаксономические отношения из существующей онтологии. - person Çağdaş; 13.05.2011
comment
Итак, насколько я понимаю, вы хотите иметь возможность накладывать ограничения на некоторые отношения, такие как рак груди, который поражает только женщин. это правильно? - person florent; 13.05.2011
comment
Просто чтобы знать, какой инструмент вы используете для определения своей онтологии? Протеже? никто? что-то другое? И есть ли у вас требования к профилю совы, который вы хотите использовать? - person florent; 13.05.2011
comment
Я использую API Jena, и у меня нет особых требований к профилю owl: только классы, отношения и ограничения. - person safé; 13.05.2011
comment
хорошо, так что вы ищете какой-то фрагмент кода? если да, то есть ли у вас основа того, что вы делаете? - person florent; 13.05.2011
comment
спасибо, я уже нашел свое решение. Как я уже сказал, я новичок в области онтологии. Я нахожу код, который мне нужен, и теперь я могу построить свою онтологию. Тем не менее, я должен копнуть глубже и узнать больше об онтологии, чтобы иметь возможность манипулировать ею. - person safé; 13.05.2011

arrow_upward
1
arrow_downward

Чтобы расширить предыдущие ответы/комментарии... SNOMED CT перегружен таксономическими отношениями. В частности, он использует отношения IS-A для организации понятий. Однако есть много других отношений. Например, такие отношения, как

Семейный анамнез мутации гена рака молочной железы 1

  • Поиск контекста: известное настоящее
  • Сопутствующая находка: положительная мутация гена BRCA1.
  • Временной контекст: текущий или прошлый субъект.
  • Контекст отношений: человек в семье субъекта

Однако не все эти определяющие свойства указаны (либо еще не сделаны, либо невозможны), и таксономия важна и фактически определяется в основном этими свойствами посредством классификации (как и во многих онтологиях).

Например. Рассмотрите следующие утверждения: «Двуногий имеет 2 ноги» (определено) и «Человек имеет 2 ноги». Классификатор сделает вывод об отношении IS-A между ними.

В любом случае, вы можете «удалить» отношения IS-A, но я не думаю, что у вас будет что-то ценное, и я не знаю, почему вы хотите исключить таксономические отношения. Они важны.

Кстати, «рак молочной железы поражает женщин», если вы используете предположение о закрытом мире, это неверное утверждение. . Мужчины также могут заболеть раком молочной железы.

И, наконец, SNOMED CT не находится в формате OWL, но может быть преобразован в такой формат (например, с использованием Perl).

person Matt C    schedule 18.12.2013

arrow_upward
0
arrow_downward

SNOMED CT интенсивно использует нетаксономические отношения и написан на OWL, так что вы можете видеть, как именно все реализовано.

person Alina    schedule 10.01.2013