Похоже, это может быть просто проблема с пробелами. Вам нужно сделать отступ для каждого тела функции. Также есть дополнительный пробел перед двоеточием в определении init_screens (хотя я думаю, что на самом деле это допустимый питон).

В случае, если отсутствие отступа было просто из-за копирования и вставки в переполнение стека, было бы полезно, если бы вы могли запустить qtile в терминале и скопировать сюда вывод/ошибку.

##### BAR #####

def init_widgets_screen():
    widgets_screen = init_widgets_list()
    return widgets_screen

def init_screens():
    return [Screen(top=bar.Bar(widgets=init_widgets_screen(), opacity=0.95, size=20))

if __name__ in ["config", "__main__"]:
    screens = init_screens()
    widgets_list = init_widgets_list()
    widget_screen = init_widgets_screen()

Изменить после уточнения

Ваш конфигурационный файл определяет функцию init_widgets_list между строками 114 и 317, и она выглядит примерно так:

def init_widgets_list():
  widgets_list = [
    [
      widget.Sep(
        linewidth = 0,
        padding = 6,
        foreground = colors[2],
        background = colors[0]
      ),
      # ...
      widget.Systray(
        background=colors[0],
        padding = 5
      ),
    ],
  ]

  return widgets_list

Вы заключаете список виджетов в другой список, а qtile ожидает плоский список виджетов. Чтобы исправить это, вам нужно удалить один набор квадратных скобок.

def init_widgets_list():
  widgets_list = [
    widget.Sep(
      linewidth = 0,
      padding = 6,
      foreground = colors[2],
      background = colors[0]
    ),
    # ...
    widget.Systray(
      background=colors[0],
      padding = 5
    ),
  ]

  return widgets_list