Какие требования необходимы для наборов данных загрузки приложения RWRMTN в Cytoscape?

Я пытаюсь использовать приложение RWRMTN в cytoscape, но мне кажется, что мой компьютер не может загрузить набор данных. Процесс использует более 90% оперативной памяти (16 ГБ; 6-ядерный процессор amd ryzen 5 3,2 ГГц) и продолжается уже 4 дня. Я новичок в этом, это нормально? Моего компьютера недостаточно для использования этого приложения?

Спасибо за помощь, Ана


person Ana C    schedule 17.08.2020    source источник


Ответы (1)


Какой набор данных не загружается? Мне удалось загрузить набор данных TargetScan и набор данных miR2Disease без каких-либо проблем, хотя у меня есть машина с 32 ГБ ОЗУ. Может быть, он пытался создать представление? Эта сеть имеет 500 000 ребер, поэтому создание представления будет довольно трудоемким.

P.S. Загрузка наборов данных на моем компьютере заняла около 8 секунд, так что что-то определенно не так. Какую версию Cytoscape вы используете?

person Scooter Morris    schedule 20.08.2020
comment
Спасибо. У меня версия 3.8.0. Я просто щелкнул "Загрузить наборы данных". Вы можете подсказать, что мне делать по-другому? Как избежать программы, чтобы попытаться создать представление. - person Ana C; 27.08.2020