R Markdown: объект не найден при выполнении воронки () в «мета-пакете»

Я знаю, что мой вопрос похож на предыдущий поток. Однако я считаю, что мой случай другой. У меня возникает ошибка Object not found при вязании уценки. Однако я считаю, что набор данных загружается правильно в среде R Markdown.

Ниже приведен фрагмент кода, который я написал в своем R Markdown:

library(meta)
library(metafor)
library(readxl)

data.binary <- read_xlsx(path="data/metabin.xlsx")
View(data.binary)

ma.binary <- metabin(
                    event.e = ee,
                    n.e = ne,
                    event.c = ec,
                    n.c = nc,
                    studlab = paste(Author),
                    data = data.binary,
                    comb.fixed = TRUE,
                    comb.random = TRUE,
                    method.tau = "DL",
                    hakn = FALSE,
                    prediction = TRUE,
                    sm = "RR"
                    )
forest(ma.binary)

funnel(ma.binary, xlab = "Risk Ratio")

Приведенный выше фрагмент возвращает эту ошибку:

Error in funnel(ma.binary, xlab = "Risk Ratio") : object 'ma.binary' not found Calls: <Anonymous> ... withCallingHandlers -> withVisible -> eval -> eval -> funnel

Я попытался очистить свою среду с помощью rm(list = ls()), но проблема не устранена. Кроме того, когда я удаляю часть funnel(ma.binary, xlab = "Risk Ratio"), фрагмент работает отлично, поэтому я считаю, что набор данных загружается правильно в R Markdown.

Что-то не так с моим фрагментом кода?

Огромное спасибо за помощь

Лучший,


r meta r-markdown
person Gilbert    schedule 22.01.2021    source источник
comment
Вы пробовали явное расстояние между именами, metafor::funnel?   -  person latlio    schedule 22.01.2021
comment
Большое спасибо за ответ. Да, я пробовал явное расстояние между именами, но проблема не устранена.   -  person Gilbert    schedule 22.01.2021
comment
и я предполагаю, что вы также пытались перезапустить сеанс R?   -  person latlio    schedule 22.01.2021