Я пытаюсь построить плавную линию между точками для трех разных групп значений:
test <- data.frame(treatment_group = as_factor(c("control",
"Fgf8+_wk3-wk4",
"Fgf8+_wk3-wk5",
"Fgf8+_wk3-wk7")),
ACTB = c(1.00,1.12,7.07,0.74),
GAPDH = c(1.00,1.15,7.38,0.83),
AVERAGE = c(1.00,1.10,7.22,0.78)
)
Использование geom_xspline
, как предложено здесь, работает хорошо, однако в этом конкретном случае линии почти полностью совпадают в нескольких точках.
ggplot(df,
aes(x = treatment_group, y = value,
group = relative_to, colour = relative_to)) +
geom_point() +
geom_xspline(aes(x = treatment_group, y = value,
group = relative_to, color = relative_to),
spline_shape = -0.5,
size = 0.5) +
theme_minimal()
Попытка сместить точки и сплайн приводит к странным результатам, и я не могу понять, как это исправить:
ggplot(test,
aes(x = treatment_group, y = value,
group = relative_to, colour = relative_to)) +
geom_point(position = position_dodge(preserve = "total", width = 0.5)) +
geom_xspline(aes(x = treatment_group, y = value,
group = relative_to, color = relative_to),
# rep_ends = TRUE,
spline_shape = -0.5,
df = 4,
size = 0.5,
all_knots = TRUE,
position = position_dodge(preserve = "total", width = 0.5)) +
# spar = 0.1, tol = 1
theme_minimal()
Я пробовал другие настройки position()
, но ни один из них не избавляет от зубчатой линии в первом сегменте. Любые подсказки приветствуются.
position = position_jitterdodge(dodge.width = 0.25)) +
position = position_stack(vjust = 0.1)) +