Похоже, что в Markerclusterer/Markerclusterplus для API V3 есть огромная ошибка: на (в основном) уровне масштабирования 2 не все маркеры сгруппированы.
Однако то же самое происходит и в примерах спидтестов (демо!) справочных страниц Google: Markercluster с API V2 работает нормально, а с V3 — нет. Я объединил все версии теста скорости с помощью iframe, чтобы вы могли легко сравнить разные версии: http://findini.com/apps/map/markertest/?visit=sec.
Без понятия. Кто-нибудь знает обходной путь?