Вопросы по теме 'bcftools'

Запуск цикла по нескольким типам файлов с использованием bcftools и awk для разделения файлов
Уважаемое сообщество переполнения стека, У меня есть 100 файлов .VCF (тип файла txt). В столбце «ID» есть различные вызовы структурных вариантов: MantaINS MantaINV MantaDEL MantaBND MantaDUP Canvas:REF Canvas:GAIN Canvas:LOSS (рядом с...
241 просмотров
schedule 18.11.2022

Сценарий Bash, использующий gzip и bcftools, не хватает памяти из-за больших файлов
Этот bash-скрипт является частью конвейера, обрабатывающего заархивированный файл .vcf, содержащий геномы нескольких пациентов (это означает, что файлы имеют огромный размер даже в заархивированном виде, например, 3–5 ГБ). Моя проблема в том, что...
62 просмотров