Вопросы по теме 'bcftools'
Запуск цикла по нескольким типам файлов с использованием bcftools и awk для разделения файлов
Уважаемое сообщество переполнения стека,
У меня есть 100 файлов .VCF (тип файла txt). В столбце «ID» есть различные вызовы структурных вариантов:
MantaINS
MantaINV
MantaDEL
MantaBND
MantaDUP
Canvas:REF
Canvas:GAIN
Canvas:LOSS
(рядом с...
241 просмотров
schedule
18.11.2022
Сценарий Bash, использующий gzip и bcftools, не хватает памяти из-за больших файлов
Этот bash-скрипт является частью конвейера, обрабатывающего заархивированный файл .vcf, содержащий геномы нескольких пациентов (это означает, что файлы имеют огромный размер даже в заархивированном виде, например, 3–5 ГБ).
Моя проблема в том, что...
62 просмотров
schedule
16.09.2022