Вопросы по теме 'cytoscape'
Как показать ошибки компилятора в области проблем при использовании Maven в Eclipse?
То, как я вижу ошибки компилятора, - это щелкнуть правой кнопкой мыши мой pom.xml и щелкнуть «запустить как -> установка maven», а вывод консоли показывает ошибки компилятора.
Можно ли заставить eclipse обнаруживать ошибки компилятора в режиме...
47 просмотров
schedule
24.12.2023
Преобразование матрицы смежности в файл csv
Я хочу преобразовать вывод матрицы смежности из ARACNE в файл csv с помощью python (или, возможно, R).
Файл adj настроен так, чтобы показывать один ген правильным и каждое из его взаимодействий с другими генами. Например:
A B 0.4 C 0.3
B C 0.1...
796 просмотров
schedule
04.05.2024
[простой вопрос]: импортировать .net файл (слово / вхождения) в cytoscapeКакие атрибуты какие?
Я взял корпус текста и поместил его в VosViewer, чтобы создать для меня сеть. Когда я импортирую этот файл .net в gephi, он работает нормально: я получаю семантическую сеть. Хотя я немного застрял в том, какие атрибуты выбрать для импорта в...
95 просмотров
schedule
25.11.2023
Интеграция Cytoscape в приложение R Shiny
Я пытаюсь интегрировать код для создания графика сети LesMiserables в качестве отправной точки, чтобы увидеть, можно ли интегрировать Cytoscape с R Shiny.
Код можно найти здесь:...
109 просмотров
schedule
01.12.2022
Экспорт взвешенного объекта igraph для использования Cytoscape с NetPathMiner
Я пытаюсь экспортировать объект igraph для использования в Cytoscape с пакетом NetPathMiner, и при попытке загрузить его в Cytoscape я получаю
Неверное значение, связанное с весом ключа
Код, который я использую:
G_sub <-...
256 просмотров
schedule
07.12.2023
Как решить код ответа 500 в cytargetlinker?
У меня возникла проблема, когда я следовал уроку 1 в cyTargetlinker. Каждый шаг гладкий, пока я не достиг шага 4 после того, как я выбрал «2» для функциональности «порога перекрытия». Он выдал знак «Поймано исключение при выполнении задачи» с...
26 просмотров
schedule
27.10.2022
Помощь в установке Cytoscape
Я пробовал установить и переустановить как Cytoscape, так и Java. Я немного невежественен, когда дело доходит до этих вещей, поэтому мне нужна подробная помощь.
macOS Catalina версии 10.15.4. Cytoscape 3.8.0 и Java 8 (обновление 251)
58 просмотров
schedule
25.01.2024
Как установить и запустить Cytoscape v3.8.0 на OSX не запускается
У меня проблема с последней версией Cytoscape 3.8.0. Она не запускается. Я вижу только логотип и ничего. Компьютер работает под управлением OSX 10.13.6. Я успешно использую версию Cytoscape 3.7.2, но хочу ее обновить. Когда я запустил скрипт...
517 просмотров
schedule
02.04.2024
Какие требования необходимы для наборов данных загрузки приложения RWRMTN в Cytoscape?
Я пытаюсь использовать приложение RWRMTN в cytoscape, но мне кажется, что мой компьютер не может загрузить набор данных. Процесс использует более 90% оперативной памяти (16 ГБ; 6-ядерный процессор amd ryzen 5 3,2 ГГц) и продолжается уже 4 дня. Я...
19 просмотров
schedule
09.06.2024
Cytoscape.js Показать/скрыть метки на элементах графика при нажатии кнопки
У меня есть приложение узла, использующее Cytoscape v3.15.2. У меня есть стиль, установленный следующим образом
let cy = cytoscape({
container: document.getElementById('graph-div'),
style: [
{...
512 просмотров
schedule
13.01.2024
Относительное положение узлов Cytoscape и автоматическая настройка по отношению к фоновому изображению
У меня есть проблема в течение нескольких недель, в основном мне нужно создать карту с использованием фонового изображения и сети, такой как цитоскейп.
Я сохраняю положение узлов, но когда я переключаюсь с монитора или захожу в полноэкранный...
84 просмотров
schedule
29.03.2024
Как заставить Cytoscape распознавать крайний столбец как вес для макета
Я относительно новый пользователь Cytoscape. Я пытаюсь, чтобы мой макет учитывал атрибут краевого столбца. Краевой столбец - это гиря. Когда я нахожу указатель мыши на любой из макетов, которые включают атрибуты краев (например, направленное усилие...
33 просмотров
schedule
11.11.2022