Вопросы по теме 'r-package'

Включить пакет не-CRAN в пакет CRAN
Вопрос довольно простой. Первый: Можно ли включить не-CRAN-пакет (или биопроводник, или омега-шляпу) в CRAN-пакет и фактически использовать инструменты из этого пакета в примерах. Если да, то как настроить файл DESCRIPTION и т. д., чтобы...
775 просмотров
schedule 06.02.2024

Почему этот пакет R не устанавливается и как его исправить?
Я хотел бы включить подпрограмму Fortran в пакет R. Я всегда собирал пакеты только с помощью devtools и roxygen (поэтому мои знания могут быть довольно ограниченными). Я получаю сообщение об ошибке, которое не позволяет мне установить пакет после...
975 просмотров
schedule 01.11.2022

Ошибка при установке пакета R
Я пытаюсь выполнить шаги в: https://cran.r-project.org/doc/contrib/Leisch-CreatingPackages.pdf для установки пакета R. Все идет гладко, пока я не захожу в оболочку и не запускаю: "R CMD INSTALL -l /путь/к/библиотеке linmod" Затем я...
902 просмотров
schedule 27.09.2022

Ошибка R 3.2.3 devtools::install_version() (файл .zip не найден)
Я пытаюсь оставить инструкции о том, как настроить среду R, максимально похожую на мою в Windows. Я нашел этот поток stackoverflow, который был действительно полезен: Установка более старой версии пакета R Я могу заставить работать большинство...
1199 просмотров
schedule 07.01.2024

Заставьте R CMD INSTALL вызывать autoconf перед ./configure
когда я устанавливаю или проверяю свой собственный R-пакет, используя: devtools::check() Мне нужно иметь файл конфигурации в моем пакете. Однако было бы полезно, если бы R автоматически вызывал autoconf до и затем configure. Вы знаете,...
138 просмотров
schedule 18.10.2022

Ошибка: sh: gfortran: команда не найдена | Ubuntu 16.04
Я пытаюсь установить пакет circular , во время установки я получаю указанную ниже ошибку. Я попробовал несколько вариантов, которые были предложены в нескольких сообщениях, но это не сработало. Я также пробовал загрузить другие пакеты, такие...
8982 просмотров
schedule 06.02.2024

не разрешено из-за текущей ошибки пространства имен при вызове подпрограмм C из R
Недавно я проводил вычислительные испытания с mgcv GAM. Некоторые оригинальные функции изменены, а некоторые добавлены. Чтобы не нарушать совместимость, для каждой функции, которую я хочу изменить, я создаю новую версию с .zheyuan surfix в имени...
4566 просмотров
schedule 19.02.2024

Пакет, предлагающий `parallel`, не компилируется в windows
Я разрабатываю пакет, который предлагает пакет parallel R. (Итак, в моем DESCRIPTION есть инструкция Suggests: parallel (>= 1.13.1) . Он отлично компилируется под OSX и Linux, но не работает при сборке в Windows (с использованием win-builder...
106 просмотров
schedule 10.10.2022

Как сохранить исходные файлы при использовании функции «установить» библиотеки R devtools
Я пытаюсь собрать пакет R (DESeq2) из ​​исходного кода, чтобы я мог его отлаживать. Я установил все необходимые зависимости и следую инструкции по созданию пакетов R. Я запускаю это на CentOS 6.6, используя R-3.4.2. Я бегу :...
1278 просмотров
schedule 15.03.2024

Ошибка компиляции R для пакета fst
Я пытаюсь установить пакет fst R из CRAN, но получаю сообщение об ошибке: gcc -I"/path/apps/R/3.5.1-20180807-test/x86_64-linux-2.6-rhel6/lib64/R/include" -DNDEBUG -fopenmp -I. -Ifstcore -Ifstcore_v1 -Ifstcore/LZ4 -Ifstcore/ZSTD...
258 просмотров
schedule 29.11.2022

Воспроизводимый saveRDS со средами
Я создаю пакет R и использую data-raw и data для хранения библиотеки предопределенных RxODE моделей. Это работает очень хорошо. Однако результирующие файлы .rda изменяются при каждом поколении. Некоторые модели содержат среду R, а...
113 просмотров
schedule 27.05.2024

Как сохранить растр в пакете
Я пытаюсь сохранить растр внутри пакета как файл .rda , используя usethis::use_data . Но когда я хочу работать с растром на другом компьютере, я получаю Ошибка в .local(.Object,...): Можно ли сохранить растр в пакете? Или мне нужно...
118 просмотров
schedule 07.02.2024

Обновите существующий пакет в CRAN
У меня уже есть пакет R в CRAN, и недавно я внес некоторые изменения в пакет и хотел обновить версию в CRAN. Мне просто отправить последнюю версию, как если бы это была первая версия? Или это другой способ сделать это?
50 просмотров
schedule 19.04.2024

Импорт файла заголовка Rcpp в NAMESPACE в пакете R
Это мой первый пакет в R , у меня уже есть рабочий пакет, но я бы удалил некоторые функции перезаписи в файле cpp, поэтому я делаю заголовочный файл, который работает с одной функцией. Как я могу поместить этот заголовок в пакет? Обратите...
364 просмотров
schedule 26.05.2024

Сборка пакета R для Linux — особое внимание для data.table в DESCRIPTION и NAMESPACE
Если я использую исходный код, то все работает, но когда я создаю пакет/функцию, это дает мне ошибку. Я что-то упустил? тестовый пакет тест ‹- функция () { library("data.table") dd <- mtcars setDT(dd) dd$cnt <- 1...
37 просмотров
schedule 14.10.2022

Загрузка пакета R внутри скрипта R
Я попробовал несколько способов загрузки нескольких определенных пакетов внутри моего script.R , чтобы запустить скрипт в терминале, набрав ./Rscript script.R . Со сценарием проблем нет, но я получаю сообщение об ошибке, когда хочу загрузить пакет,...
652 просмотров
schedule 09.11.2023

Для пакета R, как эффективно переместить пакет из Depends в Imports
Скажем, у меня есть пакет с 5 пакетами в Depends файла DESCRIPTION, и я только что понял, что не рекомендуется иметь столько пакетов в Depends из-за неизбежных конфликтов импорта, которые начинают появляться по мере увеличения количества...
31 просмотров
schedule 30.10.2023