Вопросы по теме 'vegan'

R веганский упрощенный анализ: изменить матрицу расстояний
Я использую упрощенный анализ из пакета Vegan, чтобы определить, какие аминокислоты ответственны за различия в составе белка между разными образцами. Как я понял из этого обсуждения , simper() функция использует Брея-Кертиса. Мне нужно было бы...
2736 просмотров
schedule 08.12.2022

R: Суммарная частота в списке
Изменить : используются следующие пакеты: plyr и vegan . R — самая последняя версия. Мои базовые данные таковы: X1 = c('Archea01', 'Bacteria01', 'Bacteria02') Sample1 = c(0.2,NA,NA) Sample2 = c(0, 0.001, NA) Sample3 = c(0.04, NA, NA) df...
786 просмотров
schedule 11.11.2023

anova.cca не может найти объект в пользовательской функции
Я хочу выполнить ту же последовательность анализа rda (подгонка модели, проверка значимости модели, оси и термина, построение данных) для подмножеств одних и тех же наборов данных. Поэтому я написал функцию. Теперь проблема в том, что вызов функции...
256 просмотров
schedule 28.05.2024

Кривые разрежения в RStudio. Как добавить метки в конец строк?
Я использую R для создания простой кривой, это делает хороший график, и я могу раскрашивать и добавлять метки к оси или заголовку. Но я не могу заставить его показывать метки сюжета. Кто-нибудь поможет? Ниже то, с чего я начал....
1419 просмотров
schedule 18.03.2024

Как запустить vegan::varpart без этой ошибки сообщения NA/NaN/Inf в вызове внешней функции (arg 1)?
В настоящее время я пытаюсь запустить функцию varpart для некоторых своих данных, но каждый раз получаю следующую ошибку: «Ошибка в qr.default(X, tol = 1e-06): NA/NaN/Inf в вызове внешней функции (arg 1)" Короче говоря, весь мой набор данных...
286 просмотров
schedule 02.11.2022