Най-лесният начин да накарате програма да се минимизира в системната област с помощта на .NET 4

Пример във форума на MSDN

Ето бърз пример, който показва как да минимизирате до областта за уведомяване. Трябва да добавите препратки към сборките System.Window.Forms и System.Drawing.

public partial class Window1 : System.Windows.Window
{

    public Window1()
    {
        InitializeComponent();

        System.Windows.Forms.NotifyIcon ni = new System.Windows.Forms.NotifyIcon();
        ni.Icon = new System.Drawing.Icon("Main.ico");
        ni.Visible = true;
        ni.DoubleClick += 
            delegate(object sender, EventArgs args)
            {
                this.Show();
                this.WindowState = WindowState.Normal;
            };
    }

    protected override void OnStateChanged(EventArgs e)
    {
        if (WindowState == System.Windows.WindowState.Minimized)
            this.Hide();

        base.OnStateChanged(e);
    }
}

Имах успех с помощта на тази безплатна реализация на икона за известяване в WPF.

http://www.hardcodet.net/projects/wpf-notifyicon

Настройването е доста лесно и изходният код е предоставен. Не разчита на Windows Forms, така че е „чист“ WPF и много персонализиран.

Можете да намерите урок как да го използвате в CodeProject.
А ето и пакета Nuget

Добавете notifyIcon към вашето приложение от Toolbox.
Изберете вашето основно form ›› отидете на Properties ›› изберете иконата Events ›› под FromClosing event въведете MainForm_FormClosing ›› натиснете enter.

В отворения файл .cs въведете следното действие за събитие:

private void MainForm_FormClosing(object sender, FormClosingEventArgs e)
{
     this.Hide();
     notifyIcon.Visible = true;
     ShowInTaskbar = false;
     e.Cancel = true;
}

Сега основният ви прозорец на ФОРМУЛЯР ще бъде минимизиран до системната област, когато щракнете върху бутона X. Следващата стъпка е да върнете FORM обратно в нормално състояние.
Отидете до Properties на вашия notifyIcon ›› намерете DoubleClick event ›› въведете NotifyIcon_DoubleClick и натиснете enter, за да получите функция за събитие, създадена за вас.

Поставете този код във вашето събитие:

private void NotifyIcon_DoubleClick(object sender, EventArgs e)
{
    this.Show();
    notifyIcon.Visible = false;
}

Сега, ако искате да направите иконата за известяване в изискан стил, можете да добавите контекстно меню и да го свържете с вашата икона за известяване, така че да получите нещо подобно:

Ето къде свързвате contextMenuStrip с NotifyIcon:

Късмет!