PyMOL: Вземете последователност от избор

Направих селекция от остатъци като тази:

fetch 1bsx
select interface_1bsx, byres((1bs and chain A) within 5A of (1bsx and chain X))

Как да получа последователността от interface_1bsx?


alignment pymol
person Mehdi Nellen    schedule 03.03.2014    source източник
comment
Можете ли да pyp pymol през терминала?   -  person Maarten    schedule 07.10.2014

Отговори (1)


arrow_upward
4
arrow_downward

Използвайте командата iterate (pymol wiki):

iterate interface_1bsx, resn

Или ако предпочитате да го имате в списък на Python:

residues = []
iterate interface_1bsx, residues.append(resn)
print(residues)
person gncs    schedule 16.05.2014