Опция Append = TRUE на функцията R dump().

Всъщност погледнахте ли изходния файл?

Dump записва името на променливата с присвояването на файла. Това означава, че когато поискате dump("xy"), той ще изпише

xy <- ...

и когато го стартирате отново, той ще добави изхода към същия файл, така че в крайна сметка ще пише

xy <- ...
xy <- ...

Току-що дефинирахте променливата xy два пъти и последната стойност печели. Опцията append няма да добави данни към всеки елемент от файла, тя просто добавя още текст в края на файла. Трябва сами да прочетете/обедините данните, преди да ги изхвърлите отново.

Въпреки това, ако изхвърляте data.frame, вероятно ще е по-добре да използвате write.table и да използвате append=T и read.table. По-вероятно е това да е правилното поведение за вас. Нещо като

#Simulate data 
x <- rnorm(10)
y <- rnorm(10)
xy <- data.frame(x,y)

fn<-"xy.txt"
if(file.exists(fn)) {
    xy <- rbind(read.table(fn), xy)
}
write.table(xy,file=fn)
rm(xy)  # remove the dataset form current environment

#Retrieve data from file: 
xy <- read.table(fn)

Или може би

#Simulate data 
x <- rnorm(10)
y <- rnorm(10)
xy <- data.frame(x,y)

fn<-"xy.txt"
if(file.exists(fn)) {
    write.table(xy, file=fn, row.names=F, col.names=F, append=T)
} else {
    write.table(xy, file=fn, row.names=F, col.names=T)
}
rm(xy)  # remove the dataset form current environment

#Retrieve data from file: 
xy <- read.table(fn, header=T)