Операцията за вмъкване на разредена матрица RcppEigen дава грешка на невалиден клас „dgCMatrix“.

Опитвам се да ускоря използването на C++ за бързо изграждане на някои разредени матрици за използване в R. Изглежда обаче не мога да използвам метода на вмъкване, за да променя единични елементи на разредена матрица в Eigen и да получа правилен R обект на клас dgCMatrix. Един прост пример е по-долу.

Кодът на C++ е:

#include <RcppEigen.h>

// [[Rcpp::depends(RcppEigen)]]
using Eigen::SparseMatrix;              // sparse matrix

// [[Rcpp::export]]
SparseMatrix<double> SimpleSparseMatrix(int n) {
  SparseMatrix<double> new_mat(n, n);
  new_mat.insert(0, 0) = 2;
  Rcpp::Rcout << new_mat << std::endl;
  return new_mat;
}

И полученото R е:

> SimpleSparseMatrix(2)
2 0 
0 0 

2 x 2 sparse Matrix of class "dgCMatrix"
Error in validObject(x) : 
  invalid class “dgCMatrix” object: last element of slot p must match length of slots i and x

Както можете да видите от stdout, eigen прави правилното нещо. Полученият разреден матричен обект обаче е деформиран. Наистина, разглеждането на неговите слотове показва невалидни стойности за p:

> foo <- SimpleSparseMatrix(2)
2 0 
0 0 

> str(foo)
Formal class 'dgCMatrix' [package "Matrix"] with 6 slots
  ..@ i       : int 0
  ..@ p       : int [1:3] 0 2 4
  ..@ Dim     : int [1:2] 2 2
  ..@ Dimnames:List of 2
  .. ..$ : NULL
  .. ..$ : NULL
  ..@ x       : num 2
  ..@ factors : list()

Някакви идеи какво може да се обърка?


person user3271788    schedule 01.11.2014    source източник


Отговори (1)


След оператора insert добавете този оператор:

  new_mat.makeCompressed();
person G. Grothendieck    schedule 02.11.2014