Клъстериране в Gephi 0.8.2

Работя с набор от данни в Gephi, който е извлечен от таблица с приятели от сайт на Buddypress. Направих няколко неща с графиката, които са полезни с помощта на вградената функционалност, но бих се интересувал от по-добър алгоритъм за клъстериране от това, което е включено (използвам Force Atlas 2, за да подредя възлите). Например, бих искал да използвам моето свойство за модулност, за да групирам възли в клъстери. Опитах се да изтегля два плъгина (Girvan Newman и алгоритъм за клъстериране на Markov), но не мога да разбера как да ги приложа към моята графика. Те се показват в прозореца „клъстериране“ на работния процес, но когато ги избера, бутонът „Изпълни“ е сив. Те също така не се показват в падащото меню „плъгин“ на основния потребителски интерфейс. Някакви идеи?


person apellico    schedule 20.05.2015    source източник


Отговори (1)


Това е малко сложно. Girvan-Newman също е посивял за мен, но след няколко рестартирания на Gephi успях да го накарам да работи. Мисля, че най-доброто решение е да затворите Gephi и след това да отворите вашия .gephi файл от файловата система, като Gephi все още е затворен.

Ако не можете да стартирате алгоритъма, опитайте да изчислите от статистиката, модулността на графиката, която прилага метода за откриване на общността на Louvain към вашата графика. След модулност или изпълнение на Girvan-Newman, те присвояват на всеки възел номер на клъстер, който е клъстерът, към който принадлежат

След това можете да оцветите графиката, за да посочите различните различни дялове с отделни цветове. Това става през прозореца Дял в Gephi.

Прозорецът на дяла в Gephi, където е избрано разделяне въз основа на модулен клас.

След това можете да стартирате Force Atlas 2, за да оформите клъстерите по съответния начин.

person Yannis P.    schedule 21.05.2015
comment
А, ще го пробвам. Мислите ли, че може да има нещо общо с номера на версията на Gephi и за какво е написан плъгинът? Намерих някои други социални сайтове в споделянето, които споменаха проблеми с версиите с други несвързани плъгини... Както и да е, това е добър съвет относно вграденото клъстериране, но аз го приложих. Най-вече исках да си поиграя с някакво друго клъстериране, за да видя дали извлича различни резултати. Много е полезно обаче да знаете, че вграденият модулен клас използва Louvein, така че ви благодаря за това. - person apellico; 21.05.2015
comment
Не съм съвсем сигурен за номера на версията. Gephi е във версия 0.8.2b от почти 3 години, така че мисля, че конкретните добавки са написани точно за най-новата версия - person Yannis P.; 22.05.2015