Защо .append() не работи в този списък?

Предполагам, че проблемът ви се дължи на това, че children е property (или друг дескриптор), а не обикновен атрибут на екземпляра Scene, с който взаимодействате. Можете да получите списък с деца или да присвоите нов списък с деца към атрибута, но списъците, с които работите, всъщност не са начинът, по който класът следи своите деца вътрешно. Ако промените списъка, който получавате от scene.children, модификациите не се отразяват в класа.

Един от начините да тествате това би бил да запазите списъка от scene.children няколко пъти в различни променливи и да видите дали всички те са един и същ списък или не. Опитвам:

a = scene.children
b = scene.children
c = scene.children

print(id(a), id(b), id(c))

Подозирам, че ще получите различни ids за всеки списък.

Ето един клас, който демонстрира същия проблем, който виждате:

class Test(object):
    def __init__(self, values=()):
        self._values = list(values)

    @property
    def values(self):
        return list(self._values)

    @values.setter
    def values(self, new_values):
        self._values = list(new_values)

Всеки път, когато проверявате свойството values, ще получите нов (копиран) списък.

Не мисля, че има поправка, която да е коренно различна от това, което сте открили, че работи. Можете да рационализирате малко нещата, като използвате:

scene.children += [point]

Поради начина, по който работи операторът += в Python, това разширява списъка и след това го пренасочва обратно към scene.children (a += b е еквивалентно на a = a.__iadd__(b), ако методът __iadd__ съществува).

Според този проблем се оказва, че това е traitlets проблем. Модифицирането на елементи от self.children не задейства известие за събитие, освен ако не е дефиниран нов списък.