R Markdown Не може да се намери .bib файл в един проект, докато работи добре в друг

Rmd препраща добре във файл x, след щракване върху плета добавяне на препратки към моя списък с референти, но във файл y, също rmd файл, настроен както следва:

title: Swans
bibliography: library.bib
output: html_document


[@Ticehurst1957]
##bibloography

след плетене получавам следната грешка и няма резултат

изходен файл: essay_swan_first.knit.md

pandoc-citeproc: Не може да се намери библиотека.bib pandoc: Грешка при изпълнение на филтър /Applications/RStudio.app/Contents/MacOS/pandoc/pandoc-citeproc Грешка: преобразуването на pandoc документ е неуспешно с грешка 83 Изпълнението е спряно

Какво става?


r markdown pandoc
person Jamie Dunning    schedule 05.11.2015    source източник
comment
Потенциално разгледайте stackoverflow.com/questions/25191744/? Току-що потърсих в Google кода на грешката и изглежда разумно.   -  person Akhil Nair    schedule 05.11.2015
comment
къде са вашият rmarkdown и bib файл? Възможно е вашият wd да не е това, което мислите, че е, особено ако работите с проект на Rstudio и вложени поддиректории. Можете да опитате да зададете пътя до library.bib спрямо корена на вашия проект   -  person scoa    schedule 06.11.2015
comment
@scoa изглежда свърши работа. Премести лигавника. Файл към същия като текущия ми проект. Благодаря за вашата помощ   -  person Jamie Dunning    schedule 06.11.2015

Отговори (1)


arrow_upward
2
arrow_downward

knitr очаква всички пътища да бъдат абсолютни или относителни към вашата текуща R работна директория. В проект на Rstudio работната директория е тази, в която е създаден проектът (можете да проверите това с getwd()).

Трябва или да адаптирате своя YAML хедър към:

---
bibliography: /path/to/library.bib
---

Или копирайте library.bib в папката на текущия ви проект на rstudio

person scoa    schedule 06.11.2015