Използвах Neighbor-joining, за да изведа филогенетично дърво. Направих също стартиране, но не е ясно как да сравня топологиите на репликите на първоначалното зареждане с тази на оригиналното дърво. Например възел А на оригиналното дърво възстановен ли е в репликата на Boostrap? Какъв е алгоритъмът за сравняване на топологията на две невкоренени дървета?
Пример:
Две дървета, които трябва да се сравнят, за да се види дали някои възли са различни