Инсталирах Linpack на клъстер с 2 възела с процесори Xeon. Понякога, ако стартирам Linpack с тази команда:
mpiexec -np 28 -print-rank-map -f /root/machines.HOSTS ./xhpl_intel64
linpack стартира и отпечатва изхода, понякога виждам отпечатани само съпоставянията на mpi и след това нищо не следва. За мен това изглежда като случайно поведение, защото не променям нищо между повикванията и както вече споменах, Linpack понякога стартира, понякога не. В top мога да видя, че xhpl_intel64процесите са създадени и те използват силно процесора, но когато наблюдавам трафика между възлите, iftop ми казва, че нищо не се изпраща.
Използвам MPICH2 като реализация на MPI. Това е моят HPL.dat:
# cat HPL.dat
HPLinpack benchmark input file
Innovative Computing Laboratory, University of Tennessee
HPL.out output file name (if any)
6 device out (6=stdout,7=stderr,file)
1 # of problems sizes (N)
10000 Ns
1 # of NBs
250 NBs
0 PMAP process mapping (0=Row-,1=Column-major)
1 # of process grids (P x Q)
2 Ps
14 Qs
16.0 threshold
1 # of panel fact
2 PFACTs (0=left, 1=Crout, 2=Right)
1 # of recursive stopping criterium
4 NBMINs (>= 1)
1 # of panels in recursion
2 NDIVs
1 # of recursive panel fact.
1 RFACTs (0=left, 1=Crout, 2=Right)
1 # of broadcast
1 BCASTs (0=1rg,1=1rM,2=2rg,3=2rM,4=Lng,5=LnM)
1 # of lookahead depth
1 DEPTHs (>=0)
2 SWAP (0=bin-exch,1=long,2=mix)
64 swapping threshold
0 L1 in (0=transposed,1=no-transposed) form
0 U in (0=transposed,1=no-transposed) form
1 Equilibration (0=no,1=yes)
8 memory alignment in double (> 0)
редакция 2:
Сега просто оставям програмата да работи известно време и след 30 минути ми казва:
# mpiexec -np 32 -print-rank-map -f /root/machines.HOSTS ./xhpl_intel64
(node-0:0,1,2,3,4,5,6,7,8,9,10,11,12,13,14,15)
(node-1:16,17,18,19,20,21,22,23,24,25,26,27,28,29,30,31)
Assertion failed in file ../../socksm.c at line 2577: (it_plfd->revents & 0x008) == 0
internal ABORT - process 0
APPLICATION TERMINATED WITH THE EXIT STRING: Hangup (signal 1)
Това проблем с mpi ли е?
Знаете ли какъв тип проблем може да бъде това?
