Решено чрез рестартиране :)
Използвам arch linux.
Изпълнявам Spring Batch Job в рамките на SCDF (Spring Cloud Dataflow) приложение за задачи. Всички SCDF приложения се изпълняват като микроуслуги в докер контейнери. Стартирах ги с docker-compose. Започнах да получавам Nullpointer Exception в FaultTolerantChunkProcessor.java дори при връщане обратно към предишна работеща версия на моя код.
Междувременно актуализирах системата си...
...когато рестартирах, всичко отново работеше добре.
Подозирам, че се дължи на начина, по който докерът взаимодейства с моята операционна система.
