Вопросы по теме 'rpy2'
RPy2 robjects.r.pie выдает любопытную ошибку: значения x должны быть положительными
Я чувствую себя ужасно глупо, но я не могу понять это. Я пытаюсь сделать круговую диаграмму, используя rpy2 в Python.
from rpy2.robjects import r
import os.path
image = "test.png"
values = [0.5, 0.5]
print "using R"
r.png(image, width=100,...
635 просмотров
schedule
31.10.2023
Создание матрицы R из матрицы Numpy
Как мне создать матрицу R из матрицы numpy с помощью rpy2? Я пробовал robjects.r.matrix([the numpy matrix]) , но он не работает с матрицей np (или массивом).
736 просмотров
schedule
20.10.2022
Приоритет LD_LIBRARY_PATH и проблемы с компиляцией
Я пытаюсь установить некоторое программное обеспечение на машину с Linux (пакет rpy2 для Python, в частности, rpy2.robjects, если это имеет значение). Мне нужно, чтобы программное обеспечение искало общие библиотеки в моем локальном пространстве, а...
2690 просмотров
schedule
09.03.2024
утечка памяти с rpy
У меня есть небольшая часть в моем коде, похожая на эту (конечно, с реальными матрицами вместо заполненных нулями):
x = [rinterface.FloatSexpVector([0]*(1000**2)) for i in xrange(20)]
y = robjects.r('list')(x)
и похоже, что это вызывает...
568 просмотров
schedule
28.02.2024
rpy2 importr не работает с xts и quantmod
Я новичок в rpy2, и у меня возникли проблемы с использованием importr для импорта пакетов R «xts» и «quantmod»
Код:
from rpy2.robjects.packages import importr
xts = importr('xts')
quantmod = importr('quantmod')
Ошибки:
LibraryError:...
925 просмотров
schedule
11.02.2024
Вызов пользовательских функций из Python с использованием rpy2
Есть ли способ вызвать функции, определенные в файле, скажем, myfunc.r
---------------myfunc.r --------------
myfunc = function(){
return(c(1,2,3,4,5,6,7,8,9,10))
}
getname = function(){
return("chart title")
}
---- Python
How to call...
9793 просмотров
schedule
11.11.2022
Установка модуля Python rpy2 после установки Enthought Canopy
Некоторые из моих скриптов Python используют rpy2 в качестве интерфейса для R, который отлично работал с предыдущим Python Enthought EPD.
Недавно я установил Canopy Python от Enthought. Теперь Python больше не находит модуль rpy2, и когда я...
3800 просмотров
schedule
03.10.2022
Подготовьте строку Python для R, используя rpy2
Этот вопрос относится к переменной python для R и, возможно, также к это объекты python в rpy2 , но ни один из двух полностью не перекрывается, и первый на самом деле без ответа.
Мой вопрос на самом деле очень простой. У меня есть строка,...
1161 просмотров
schedule
20.11.2023
rpy2 зоопарк неиспользуемый аргумент
Недавно я пытался использовать rpy2 и импортировать библиотеку зоопарка в python. однако, когда я запускаю следующие наборы кода, я получаю следующую ошибку
from rpy2.robjects.packages import importr
r_zoo = importr("zoo")
r_zoo.rollapply(ddf,FUN...
259 просмотров
schedule
31.10.2023
передача списка в качестве аргумента через rpy2
Я использую функцию R spi в Python. Один из аргументов («ядро») требует списка, и я не уверен, как передать его при использовании rpy2. Синтаксис R будет следующим ( с аргументом «ядро»):
library("lmomco", lib.loc="~/lib/R_libs")...
173 просмотров
schedule
02.04.2024
снова получил ошибку, когда я устанавливаю rpy2 (скомпилирован llvm в brew)
Когда я запустил «pip install rpy2», он сообщил об ошибке:
clang: ошибка: неподдерживаемый параметр '-fopenmp'
Я установил llvm с brew, так как он поддерживает эту опцию. Но мне нужно связать llvm (clang-5.0) brew с командой clang. Затем...
47 просмотров
schedule
11.05.2024
Запуск glmnet с rpy2 на разреженной матрице дизайна?
У меня есть фрагмент python, который отлично работает для запуска GLMNET на np.array X и y. Однако, когда X представляет собой разреженную матрицу столбцов из scipy, код дает сбой, поскольку rpy2 не может преобразовать X. Я делаю очевидную ошибку?...
474 просмотров
schedule
29.01.2024
rpy2 rmagic для ipython, преобразующий тире в точки в именах столбцов dataframe
Я использую rpy2 через rmagic для чередования кода R с кодом python3 в блокноте jupyter. Простая ячейка кода:
%%R -i df -o df_out
df_out <- df
возвращает некоторые измененные имена столбцов, например. CTB-102L5.4 становится...
107 просмотров
schedule
23.03.2024
Как загрузить файлы .rdata R в Python?
Я пытаюсь преобразовать одну часть кода R в Python. В этом процессе я сталкиваюсь с некоторыми проблемами.
У меня есть код R, как показано ниже. Здесь я сохраняю выходные данные R в формате .rdata .
nms <- names(mtcars)...
5954 просмотров
schedule
14.05.2024
Как получить вывод missForest с помощью rpy2 в Python?
Я использую rpy2 для запуска пакета R missforest в python. Я знаю, что в python есть пакет Missingpy, который работает аналогично пакету missforest в R, но я хочу протестировать другие пакеты вменения, доступные в R, такие как Amelia, Hmisc. Ниже...
100 просмотров
schedule
08.03.2024
Как использовать имя переменной, разделенное пробелами, в as.factor() для доступа к данным фрейма данных?
Когда возникла проблема?
Я пытался использовать метод polr() для R (через rpy2 ) для порядкового регрессионного анализа с использованием следующего утверждения. В этом утверждении количество шагов является моей зависимой переменной. Когда...
67 просмотров
schedule
16.11.2023
